#Author: Pierre Ratinaud
-#Copyright (c) 2008-2011 Pierre Ratinaud
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pp<-function(txt,val) {
d<-paste(txt,' : ')
lo[1:nrow(dtable)] <- 0
for (k in 1:nrow(ln)) {lo[[ln[k,1]]]<-append(lo[[ln[k,1]]],ln[k,2])}
for (k in 1:nrow(dtable)) {lo[[k]] <- lo[[k]][-1]}
- lo<-lo[-c(1,length(lo))]
- for (l in lo) {
- compte <- compte + 1
- chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
- chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
- chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
- if (chi>maxinter) {
- maxinter<-chi
- rmax<-compte
- }
- }
+ ## lo<-lo[-c(1,length(lo))]
+ ## for (l in lo) {
+ ## compte <- compte + 1
+ ## chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
+ ## chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
+ ## chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
+ ## if (chi>maxinter) {
+ ## maxinter<-chi
+ ## rmax<-compte
+ ## }
+ #}
+ lo<-lo[-c(1)]
+ for (l in lo) {
+ chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
+ if (chi>maxinter) {
+ maxinter<-chi
+ rmax<-compte
+ }
+ compte <- compte + 1
+ chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
+ chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
+ }
res <- list(maxinter=maxinter, rmax=rmax)
res
}
-CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, libsvdc=FALSE, libsvdc.path=NULL){
+
+
+
+
+CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, svd.method, libsvdc.path=NULL){
# sink('/home/pierre/workspace/iramuteq/dev/findchi2.txt')
dataori <- data.in
row.names(dataori) <- rownames(data.in)
#extraction du premier facteur de l'afc
print('afc')
pp('taille dtable dans boucle (col/row)',c(ncol(dtable),nrow(dtable)))
- afc<-boostana(dtable, nd=1, libsvdc=libsvdc, libsvdc.path=libsvdc.path)
+ afc<-boostana(dtable, nd=1, svd.method = svd.method, libsvdc.path=libsvdc.path)
pp('SV',afc$singular.values)
pp('V.P.', afc$eigen.values)
coordrow <- as.matrix(afc$row.scores[,1])
rmax <- NULL
inert <- find.max(dtable, chitable, compte, rmax, maxinter, sc, TT)
- print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
+ print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
pp('max inter phase 1', inert$maxinter/TT)#max(listinter))
print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
ordert <- ordert[order(ordert[,3]),]
print('###################################')
print('longueur < 0')
malcl<-length(vdelta)
+
if ((it>1)&&(!is.logical(listsub[[it]]))&&(!is.logical(listsub[[it-1]]))){
- if (listsub[[it]]==listsub[[(it-1)]]){
+ if (all(listsub[[it]]==listsub[[(it-1)]])){
malcl<-0
}
}
#t2<-dtable[dtable[,'cl']==clnb+1,][,-ncol(dtable)]
t1<-dtable[which(cl[,1]==clnb),]#[,-ncol(dtable)]
t2<-dtable[which(cl[,1]==clnb+1),]#[,-ncol(dtable)]
- if (class(t1)=='numeric') {
+ if (inherits(t1, "numeric")) {
sc1 <- as.vector(t1)
nrowt1 <- 1
} else {
sc1 <- colSums(t1)
nrowt1 <- nrow(t1)
}
- if (class(t2)=='numeric') {
+ if (inherits(t2, "numeric")) {
sc2 <- as.vector(t2)
nrowt2 <- 1
} else {