merge graphs
[iramuteq] / textreinert.py
1 # -*- coding: utf-8 -*-
2 # Author: Pierre Ratinaud
3 # lisence : GNU GPL
4 # copyright : 2014 (c) Pierre Ratinaud
5
6 import os
7 from time import time
8 from analysetxt import AnalyseText
9 from OptionAlceste import OptionAlc 
10 from PrintRScript import RchdTxt, ReinertTxtProf, TgenProfScript
11 from layout import PrintRapport
12 from chemins import ChdTxtPathOut, PathOut
13 from functions import DoConf, print_liste, TGen
14
15
16 class Reinert(AnalyseText) :
17     def doanalyse(self) :
18         self.parametres['type'] = 'alceste'
19         self.pathout.basefiles(ChdTxtPathOut)
20         self.actives, lim = self.corpus.make_actives_nb(self.parametres['max_actives'], 1)
21         self.parametres['eff_min_forme'] = lim
22         self.parametres['nbactives'] = len(self.actives)
23         uci = False
24         if self.parametres['classif_mode'] == 0 :
25             lenuc1, lenuc2 = self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uc(self.actives, self.parametres['tailleuc1'], self.parametres['tailleuc2'], self.pathout['TableUc1'], self.pathout['TableUc2'], self.pathout['listeuce1'], self.pathout['listeuce2'])
26             self.parametres['lenuc1'] = lenuc1
27             self.parametres['lenuc2'] = lenuc2
28         elif self.parametres['classif_mode'] == 1 :
29             self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uces(self.actives, self.pathout['TableUc1'], self.pathout['listeuce1'])
30         elif self.parametres['classif_mode'] == 2 :
31             self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uci(self.actives, self.pathout['TableUc1'], self.pathout['listeuce1'])
32             uci = True
33         Rscript = self.printRscript()
34         result = self.doR(Rscript, dlg=self.dlg, message='CHD...')
35         if not result :
36             return 'NOK'
37         self.corpus.make_ucecl_from_R(self.pathout['uce'])
38         self.corpus.make_and_write_profile(self.actives, self.corpus.lc, self.pathout['Contout'], uci = uci)
39         self.sup, lim = self.corpus.make_actives_nb(self.parametres['max_actives'], 2)
40         self.corpus.make_and_write_profile(self.sup, self.corpus.lc, self.pathout['ContSupOut'], uci = uci)
41         self.corpus.make_and_write_profile_et(self.corpus.lc, self.pathout['ContEtOut'], uci = uci)
42         self.clnb = len(self.corpus.lc)
43         self.parametres['clnb'] = self.clnb
44         Rscript = self.printRscript2()
45         self.doR(Rscript, dlg=self.dlg, message='profils et A.F.C. ...')
46         self.time = time() - self.t1
47         minutes, seconds = divmod(self.time, 60)
48         hours, minutes = divmod(minutes, 60)            
49         self.parametres['time'] = '%.0fh %.0fm %.0fs' % (hours, minutes, seconds)
50         self.print_graph_files()
51
52     def preferences(self) :
53         parametres = DoConf(self.parent.ConfigPath['reinert']).getoptions('ALCESTE')
54         parametres['corpus'] = self.corpus
55         parametres['pathout'] = self.pathout
56         self.dial = OptionAlc(self.parent, parametres)
57         self.dial.CenterOnParent()
58         self.dialok = self.dial.ShowModal()
59         if self.dialok == 5100 :
60             parametres['classif_mode'] = self.dial.radio_box_2.GetSelection()
61             parametres['tailleuc1'] = self.dial.spin_ctrl_1.GetValue()
62             parametres['tailleuc2'] = self.dial.spin_ctrl_2.GetValue()
63             parametres['mincl'] = self.dial.spin_ctrl_4.GetValue()
64             parametres['minforme'] = self.dial.spin_ctrl_5.GetValue()
65             parametres['nbcl_p1'] = self.dial.spin_nbcl.GetValue()
66             parametres['max_actives'] = self.dial.spin_max_actives.GetValue()
67             parametres['corpus'] = ''
68             parametres['svdmethod'] = self.dial.svdmethod[self.dial.choicesvd.GetSelection()]
69             parametres['pathout'] = self.pathout.dirout
70             parametres['mode.patate'] = self.dial.check_patate.GetValue()
71             DoConf(self.parent.ConfigPath['reinert']).makeoptions(['ALCESTE'], [parametres])
72             self.dial.Destroy()
73             print parametres
74             return parametres
75         else :
76             self.dial.Destroy()
77             return None
78
79     def printRscript(self) :
80         RchdTxt(self.pathout, self.parent.RscriptsPath, self.parametres['mincl'], self.parametres['classif_mode'], nbt=self.parametres['nbcl_p1'] - 1, svdmethod=self.parametres['svdmethod'], libsvdc=self.parent.pref.getboolean('iramuteq', 'libsvdc'), libsvdc_path=self.parent.pref.get('iramuteq', 'libsvdc_path'), R_max_mem=False, mode_patate=self.parametres['mode.patate'])
81         return self.pathout['Rchdtxt']
82
83     def printRscript2(self) :
84         ReinertTxtProf(self.pathout, self.parent.RscriptsPath, self.clnb, 0.9)
85         return self.pathout['RTxtProfGraph']
86
87     def print_graph_files(self) :
88         mess_afc = u"La position des points n'est peut être pas exacte"
89         afc_graph_list = [[os.path.basename(self.pathout['AFC2DL_OUT']), u'Variables actives - coordonnées - 30 points par classes - facteurs 1 / 2 - %s' % mess_afc],
90                       [os.path.basename(self.pathout['AFC2DSL_OUT']), u'variables supplémentaires - coordonnées - 30 points par classes - facteurs 1 / 2 - %s' % mess_afc],
91                       [os.path.basename(self.pathout['AFC2DEL_OUT']), u'Variables illustratives - Coordonnées - 30 points par classes - facteur 1 / 2 - %s' % mess_afc],
92                       [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCL_OUT']), u'Classes - Coordonnées - facteur 1 / 2']]
93         chd_graph_list = [[os.path.basename(self.pathout['dendro1']), u'dendrogramme à partir de chd1']]
94         if self.parametres['classif_mode'] == 0 :
95             chd_graph_list.append([os.path.basename(self.pathout['dendro2']), u'dendrogramme à partir de chd2'])
96         chd_graph_list.append([os.path.basename(self.pathout['arbre1']), u'chd1'])
97         if self.parametres['classif_mode'] == 0 :
98             chd_graph_list.append([os.path.basename(self.pathout['arbre2']), u'chd2'])       
99         print_liste(self.pathout['liste_graph_afc'], afc_graph_list)
100         print_liste(self.pathout['liste_graph_chd'], chd_graph_list)
101         PrintRapport(self, self.corpus, self.parametres)
102
103 class TgenProf(AnalyseText):
104     def __init__(self, ira, corpus, parametres, cluster_size):
105         self.ira = ira
106         self.corpus = corpus
107         self.parametres = parametres
108         self.pathout = PathOut(dirout = self.parametres['pathout'])
109         self.cluster_size = [len(classe) for classe in corpus.lc]
110         print cluster_size
111         self.doanalyse()
112         
113     def doanalyse(self):    
114         self.tgen = TGen(path = self.parametres['tgenpath'], encoding = self.ira.syscoding)
115         self.tgen.read(self.tgen.path)
116         #self.parametres['etoiles'].sort()
117         self.parametres['tgeneff'] = os.path.join(self.parametres['pathout'], 'tgeneff.csv') 
118         tgenst = self.corpus.make_tgen_profile(self.tgen.tgen, self.corpus.lc)
119         clnames = ['cluster_%03d' % i for i in range(1, len(self.cluster_size) + 1)]
120         et = dict(zip(clnames, self.cluster_size))
121         tgenst = dict([[line[0], dict(zip(clnames, line[1:]))] for line in tgenst]) 
122         self.tgen.writetable(self.parametres['tgeneff'], tgenst, et)
123         self.parametres['tgenspec'] = os.path.join(self.parametres['pathout'], 'tgenchi2.csv')
124         self.Rscript = TgenProfScript(self)
125         self.Rscript.make_script()
126         self.Rscript.write()
127         self.doR(self.Rscript.scriptout, dlg = False, message = 'R...')
128         
129         
130         
131         
132         
133