...+++...
[iramuteq] / layout.py
index 6550ced..8efccbf 100644 (file)
--- a/layout.py
+++ b/layout.py
@@ -6,27 +6,35 @@
 
 import os
 import wx
-#import wx.lib.agw.aui as aui
-import agw.aui as aui
-from chemins import ConstructPathOut, ChdTxtPathOut, FFF, ffr, PathOut, StatTxtPathOut
+import wx.lib.hyperlink as hl
+if wx.__version__ >= '2.11' :
+    import wx.lib.agw.aui as aui
+else :
+    import aui
+from chemins import ConstructPathOut, ChdTxtPathOut, FFF, ffr, PathOut, StatTxtPathOut, simipath
 from ConfigParser import ConfigParser
-from functions import ReadProfileAsDico, GetTxtProfile, read_list_file, ReadList, exec_rcode, print_liste, BugReport, DoConf
-from ProfList import *
+from functions import ReadProfileAsDico, GetTxtProfile, read_list_file, ReadList, exec_rcode, print_liste, BugReport, DoConf, indices_simi, check_Rresult, progressbar
+from ProfList import ProfListctrlPanel
 from guiparam3d import param3d, simi3d
-from PrintRScript import write_afc_graph, print_simi3d
-from profile_segment import *
+from PrintRScript import write_afc_graph, print_simi3d, PrintSimiScript
+from profile_segment import ProfileSegment
 from functions import ReadList
 from listlex import *
 from Liste import *
 from search_tools import SearchFrame
 from dialog import PrefGraph, PrefExport, PrefSimpleFile, PrefDendro
-from corpusNG import Corpus
+from guifunct import SelectColumn, PrepSimi, PrefSimi
+from corpus import Corpus
 import datetime
 import sys
 import tempfile
+from time import sleep
 import shutil
-import webbrowser
 import codecs
+import logging
+
+log = logging.getLogger('iramuteq.layout')
+
 
 class GraphPanelAfc(wx.Panel):
     def __init__(self, parent, dico, list_graph, clnb, itempath = 'liste_graph_afc', coding = sys.getdefaultencoding()):
@@ -40,6 +48,8 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
         self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "courier"))
         self.labels = []
         self.listimg = []
+        self.buts = []
+        self.list_graph = list_graph
         self.TabCHD = self.parent.GetParent()
         self.nb = self.TabCHD.GetParent()
         self.ira = self.nb.GetParent()
@@ -48,10 +58,21 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
         self.butafc = wx.BitmapButton(self, -1, afc_img)
         self.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.afc_graph, self.butafc)
         self.dirout = os.path.dirname(self.Dict['ira'])
+        b = 0
+        todel = []
         for i in range(0,len(list_graph)):
             if os.path.exists(os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0])) :
-                self.listimg.append(wx.StaticBitmap(self.panel_1, -1, wx.Bitmap(os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0]), wx.BITMAP_TYPE_ANY)))
+                filename, ext = os.path.splitext(list_graph[i][0])
+                if ext == '.svg' :
+                    self.listimg.append(hl.HyperLinkCtrl(self.panel_1, -1, os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0]), URL=os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0])))
+                else :
+                    self.listimg.append(wx.StaticBitmap(self.panel_1, -1, wx.Bitmap(os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0]), wx.BITMAP_TYPE_ANY)))
                 self.labels.append(wx.StaticText(self.panel_1, -1, list_graph[i][1]))
+                self.buts.append(wx.Button(self.panel_1, wx.ID_DELETE, name = `i - b`))
+            else :
+                todel.append(i)
+                b += 1
+        self.list_graph = [graph for i, graph in enumerate(self.list_graph) if i not in todel]
                 
         self.param = { 'typegraph' : 0, 
               'width' : 800,
@@ -60,8 +81,10 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
               'qui' : 0,
               'do_select_nb' : 0,
               'do_select_chi' : 0,
+              'do_select_chi_classe' : 0,
               'select_nb' : 50,
               'select_chi' : 4,
+              'nbchic' : 30,
               'over' : 0, 
               'cex_txt' : 0,
               'txt_min' : 5,
@@ -73,6 +96,7 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
               'facteur' : [1,2,3],
               'alpha' : 10,
               'clnb' : clnb,
+              'svg' : 0,
             }
 
         self.__set_properties()
@@ -91,10 +115,38 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
         for i in range(0, len(self.listimg)):
             self.sizer_3.Add(self.listimg[i], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
             self.sizer_3.Add(self.labels[i], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+            self.sizer_3.Add(self.buts[i], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+            self.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.on_delete_image, self.buts[i])
         self.panel_1.SetSizer(self.sizer_3)
         self.sizer_2.Add(self.panel_1, 1, wx.EXPAND, 0)
         self.SetSizer(self.sizer_2) 
 
+    def on_delete_image(self, event) :
+        image_id = int(event.GetEventObject().GetName())
+        image_path = self.list_graph[image_id][0]
+        message = 'This file will be delete : %s.\nAre you sure ?' % os.path.join(self.dirout, image_path)
+        dial = wx.MessageDialog(self, message, style = wx.YES_NO)
+        res = dial.ShowModal()
+        if res == wx.ID_YES :
+            dial.Destroy()
+            log.info('delete image %i' % image_id)
+            oldimg = self.listimg.pop(image_id)
+            oldimg.Destroy()
+            oldlab = self.labels.pop(image_id)
+            oldlab.Destroy()
+            oldbut = self.buts.pop(image_id)
+            oldbut.Show(False)
+            for i, but in enumerate(self.buts) :
+                but.SetName(`i`)
+            todel = self.list_graph.pop(image_id)
+            os.remove(os.path.join(self.dirout, todel[0]))
+            print_liste(self.Dict[self.itempath], self.list_graph)
+            self.sizer_3.Fit(self.panel_1)
+            self.Layout()
+        else :
+            dial.Destroy()
+        
+
     def afc_graph(self,event):
         #dirout = os.path.dirname(self.Dict['ira'])
         while os.path.exists(os.path.join(self.dirout,'graph_afc_'+str(self.afcnb)+'.png')):
@@ -104,6 +156,10 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
         dial.CenterOnParent()
         val = dial.ShowModal()
         if val == wx.ID_OK :
+            if dial.choix_format.GetSelection() == 0 :
+                svg = 0
+            else :
+                svg = 1
             self.param = {'typegraph' : dial.choicetype.GetSelection(),
                           'width' : dial.spin1.GetValue(),
                           'height' : dial.spin2.GetValue(),
@@ -111,8 +167,10 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
                           'qui' : dial.choice2.GetSelection(),
                           'do_select_nb' : dial.check1.GetValue(),
                           'do_select_chi' : dial.check2.GetValue(),
+                          'do_select_chi_classe' : dial.check_chic.GetValue(),
                           'select_nb' : dial.spin_nb.GetValue(),
                           'select_chi' : dial.spin_chi.GetValue(),
+                          'nbchic' : dial.spin_nbchic.GetValue(),
                           'over' : dial.check3.GetValue(), 
                           'cex_txt' : dial.check4.GetValue(),
                           'txt_min' : dial.spin_min.GetValue(),
@@ -124,7 +182,8 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
                           'facteur' : [dial.spin_f1.GetValue(),dial.spin_f2.GetValue(), dial.spin_f3.GetValue()],
                           'clnb' : self.clnb,
                           'film' : str(dial.film.GetValue()).upper(),
-                          'alpha' : dial.slider_sphere.GetValue()
+                          'alpha' : dial.slider_sphere.GetValue(),
+                          'svg' : svg
                         }
             self.nb.parent = self.ira
             self.DictPathOut = self.Dict
@@ -146,9 +205,8 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
                 """
             txt += write_afc_graph(self)
             filetmp = tempfile.mktemp()
-            file = open(filetmp,'w')
-            file.write(txt)
-            file.close()
+            with open(filetmp, 'w') as f :
+                f.write(txt)
             pid = exec_rcode(self.ira.RPath, filetmp)
             check_Rresult(self.ira, pid)
             if self.param['typegraph'] == 0 :
@@ -166,11 +224,21 @@ class GraphPanelAfc(wx.Panel):
                 if self.param['over'] : txt += u' - Eviter les recouvrements'
                 if self.param['cex_txt'] : txt += u' - taille du texte proportionnel à la masse'
                 if self.param['tchi'] : txt += u' - taille du texte proportionnel au chi2 d\'association'
-                list_graph = read_list_file(self.DictPathOut[self.itempath], self.coding)
-                list_graph.append([self.fileout, txt])
-                print_liste(self.DictPathOut[self.itempath], list_graph)
-                self.sizer_3.Add(wx.StaticBitmap(self.panel_1, -1, wx.Bitmap(self.fileout, wx.BITMAP_TYPE_ANY)), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
-                self.sizer_3.Add(wx.StaticText(self.panel_1,-1, txt), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                #list_graph = read_list_file(self.DictPathOut[self.itempath], self.coding)
+                if self.param['svg'] :
+                    filename, ext = os.path.splitext(self.fileout)
+                    self.fileout = filename + '.svg'
+                self.list_graph.append([os.path.basename(self.fileout), txt])
+                print_liste(self.DictPathOut[self.itempath], self.list_graph)
+                if not self.param['svg'] :
+                    self.listimg.append(wx.StaticBitmap(self.panel_1, -1, wx.Bitmap(self.fileout, wx.BITMAP_TYPE_ANY)))
+                else :
+                    self.listimg.append(hl.HyperLinkCtrl(self.panel_1, -1, self.fileout, URL=self.fileout))
+                self.sizer_3.Add( self.listimg[-1], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.labels.append(wx.StaticText(self.panel_1,-1, txt))
+                self.sizer_3.Add(self.labels[-1], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.buts.append(wx.Button(self.panel_1, wx.ID_DELETE, name = `len(self.list_graph) - 1`))
+                self.sizer_3.Add(self.buts[-1], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
                 self.sizer_3.Fit(self.panel_1)
                 self.Layout()
     
@@ -183,7 +251,7 @@ class GraphPanel(wx.ScrolledWindow):
         self.Dict = dico
         self.txt = txt
         self.parent = parent
-        self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "courier"))
+        self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.FONTWEIGHT_BOLD, 0, "courier"))
         self.labels = []
         self.listimg = []
         self.dirout = os.path.dirname(self.Dict['ira'])
@@ -210,7 +278,18 @@ class GraphPanel(wx.ScrolledWindow):
         self.sizer_2.Add(self.sizer_1, 1, wx.EXPAND, 0)
         self.SetSizer(self.sizer_1)
         self.sizer_1.Fit(self)
-        
+       
+
+def open_antiprofil(panel, AntiProfile, encoding) :
+    DictAnti = ReadProfileAsDico(AntiProfile, True, encoding)
+    panel.AntiProfNB = aui.AuiNotebook(panel, -1, wx.DefaultPosition)
+    for i in range(0, panel.parametres['clnb']):
+        tabantiprofile = ProfListctrlPanel(panel, panel, DictAnti[str(i + 1)], True, i + 1)
+        panel.AntiProfNB.AddPage(tabantiprofile, 'classe %s' % str(i + 1))
+    panel.TabChdSim.AddPage(panel.AntiProfNB, 'Antiprofils')
+
+
+
 class OpenCHDS():
     def __init__(self, parent, corpus, parametres, Alceste=False):
        #sep = u'\n ' 
@@ -222,84 +301,61 @@ class OpenCHDS():
        self.pathout.basefiles(ChdTxtPathOut)
        DictPathOut = self.pathout 
        self.DictPathOut = DictPathOut
+       self.dictpathout = DictPathOut
        self.parent = parent
 
        Profile = DictPathOut['PROFILE_OUT']
        AntiProfile = DictPathOut['ANTIPRO_OUT']
+       self.encoding = self.corpus.parametres['syscoding']
        if isinstance(self.corpus, Corpus) :
-            self.encoding = self.corpus.parametres['syscoding']
             self.corpus.make_ucecl_from_R(self.pathout['uce'])
-       elif 'tableau' in dir(gparent) :
-            self.encoding = gparent.tableau.parametres['syscoding']
-
-       #AnalyseConf = ConfigParser()
-       #AnalyseConf.readfp(codecs.open(filename,'r', self.encoding))
-       #AnalyseConf.read(filename)
-       #if 'analyse' in AnalyseConf.sections() :
-       #    section = 'analyse'
-       #elif 'questionnaire' in AnalyseConf.sections() :
-       #    section = 'questionnaire'
-       #elif 'chd_dist_quest' in AnalyseConf.sections() :
-       #    section = 'chd_dist_quest'
-       #self.section = section
-       #clnb = AnalyseConf.get(section, 'clusternb')
-       #clnb = int(clnb)
+            corpname = self.corpus.parametres['corpus_name']
+       else :
+           corpname = self.corpus.parametres['name']
+
        clnb = parametres['clnb']
        dlg = progressbar(self, maxi = 4 + clnb) 
        self.clnb = clnb 
-       corpname = self.corpus.parametres['corpus_name']
        print 'lecture des profils'
        dlg.Update(2, u'lecture des profils')
  
-       DictProfile = ReadProfileAsDico(self, Profile, Alceste, self.encoding)
+       DictProfile = ReadProfileAsDico(Profile, Alceste, self.encoding)
        self.DictProfile = DictProfile
-       print 'lecture des antiprofils'
-       DictAnti = ReadProfileAsDico(self, AntiProfile, Alceste, self.encoding)
+       self.cluster_size = []
+       #print 'lecture des antiprofils'
+       #DictAnti = ReadProfileAsDico(self, AntiProfile, Alceste, self.encoding)
 
        panel = wx.Panel(parent, -1)
        sizer1 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
 
-       panel.chd_toolbar = wx.ToolBar(panel, -1, wx.DefaultPosition, wx.DefaultSize, wx.TB_FLAT | wx.TB_NODIVIDER)
-       panel.chd_toolbar.SetToolBitmapSize(wx.Size(16, 16))
+       if os.path.exists(DictPathOut['pre_rapport']):
+           with codecs.open(DictPathOut['pre_rapport'], 'r', self.encoding) as f :
+                txt = f.read()
+           self.debtext = txt
+       else :
+           self.debtext = ''
+#       panel.chd_toolbar = wx.ToolBar(panel, -1, wx.DefaultPosition, wx.DefaultSize, wx.TB_FLAT | wx.TB_NODIVIDER)
+#       panel.chd_toolbar.SetToolBitmapSize(wx.Size(16, 16))
 
        if isinstance(self.corpus, Corpus) :
            panel.corpus = self.corpus
-           self.ID_sg = wx.NewId()
-           butsg = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_sg, u"Profils des segments répétés ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butsg)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-           self.ID_export = wx.NewId() 
-           butexp = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_export, u"Exporter le corpus ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butexp)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-           self.ID_colored = wx.NewId()
-           butcol = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_colored, u"Corpus en couleur ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butcol)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-           self.ID_searchf = wx.NewId()
-           butsearchf = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_searchf, u"Outil de navigation ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butsearchf)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-
-           self.ID_proftype =wx.NewId()
-           butpt = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_proftype, u"Profils des types ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butpt)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-
-           self.ID_clusterstat =wx.NewId()
-           butclusterstat = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_clusterstat, u"Stat par classe ")
-           panel.chd_toolbar.AddControl(butclusterstat)
-           panel.chd_toolbar.AddSeparator()
-
-
-       self.ID_rapport = wx.NewId()
-       #rap_img = wx.Image(os.path.join(self.parent.images_path,'icone_rap_16.png'), wx.BITMAP_TYPE_ANY).ConvertToBitmap()
-       #panel.chd_toolbar.AddLabelTool(self.ID_rapport, "rapport", rap_img, shortHelp=u"Produire le rapport", longHelp=u"Exporter un rapport en texte simple")
-       butrap = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_rapport, u"Rapport ")
-       panel.chd_toolbar.AddControl(butrap)
-       
-       panel.chd_toolbar.Realize()
-       sizer1.Add(panel.chd_toolbar,0, wx.EXPAND, 5)
+       else :
+           panel.tableau = self.corpus
+       panel.dictpathout = self.DictPathOut
+       panel.pathout = self.DictPathOut
+       panel.parent = self.parent
+       panel.DictProfile = self.DictProfile
+       panel.cluster_size = self.cluster_size
+       panel.debtext = self.debtext
+
+#       self.ID_rapport = wx.NewId()
+#       #rap_img = wx.Image(os.path.join(self.parent.images_path,'icone_rap_16.png'), wx.BITMAP_TYPE_ANY).ConvertToBitmap()
+#       #panel.chd_toolbar.AddLabelTool(self.ID_rapport, "rapport", rap_img, shortHelp=u"Produire le rapport", longHelp=u"Exporter un rapport en texte simple")
+#       butrap = wx.Button(panel.chd_toolbar, self.ID_rapport, u"Rapport ")
+#       panel.chd_toolbar.AddControl(butrap)
+#       
+#       panel.chd_toolbar.Realize()
+#       sizer1.Add(panel.chd_toolbar,0, wx.EXPAND, 5)
 
        #self.TabChdSim = wx.aui.AuiNotebook(self.parent.nb, -1, wx.DefaultPosition)
        notebook_flags =  aui.AUI_NB_DEFAULT_STYLE | aui.AUI_NB_TAB_EXTERNAL_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_FLOAT| wx.NO_BORDER
@@ -314,19 +370,14 @@ class OpenCHDS():
        if isinstance(self.corpus, Corpus) :
            panel.TabChdSim.corpus = corpus
            panel.TabChdSim.corpus.dictpathout = self.DictPathOut
-           panel.parametres = self.parametres
+       else :
+           panel.TabChdSim.tableau = corpus
+           panel.TabChdSim.tableau.dictpathout = self.DictPathOut
+       panel.parametres = self.parametres
+       self.panel = panel
 
        self.notenb = self.parent.nb.GetPageCount()
-       if os.path.exists(DictPathOut['pre_rapport']):
-           #self.tabRap = wx.TextCtrl(self.TabChdSim, -1, "", style=wx.TE_MULTILINE | wx.TE_RICH2)
-           #self.tabRap.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "courier"))
-           with codecs.open(DictPathOut['pre_rapport'], 'r', self.encoding) as f :
-                txt = f.read()
-           #self.tabRap.write(txt)
-           #self.tabRap.ShowPosition(0)
-           self.debtext = txt
-       else :
-           self.debtext = ''
+
            
        if os.path.exists(self.DictPathOut['liste_graph_chd']) :
            list_graph = read_list_file(self.DictPathOut['liste_graph_chd'], self.encoding)
@@ -336,26 +387,26 @@ class OpenCHDS():
        panel.ProfNB = aui.AuiNotebook(panel, -1, wx.DefaultPosition)
        panel.ProfNB.SetArtProvider(aui.ChromeTabArt())
        #self.ProfNB.SetTabCtrlHeight(100)
-       panel.AntiProfNB = aui.AuiNotebook(panel, -1, wx.DefaultPosition)
+       #panel.AntiProfNB = aui.AuiNotebook(panel, -1, wx.DefaultPosition)
        if os.path.exists(DictPathOut['prof_seg']) :
-            prof_seg = ReadProfileAsDico(self, DictPathOut['prof_seg'], False, self.encoding)
+            prof_seg = ReadProfileAsDico(DictPathOut['prof_seg'], False, self.encoding)
             self.prof_seg_nb = aui.AuiNotebook(panel, -1, wx.DefaultPosition)
        for i in range(0, clnb):
+            self.cluster_size.append(DictProfile[str(i + 1)][0][0:3]) 
             dlg.Update(3+i, 'Classe %i' %(i+1))
             ind = '/'.join(DictProfile[str(i + 1)][0][0:2])
             indpour = ' - '.join([ind, DictProfile[str(i + 1)][0][2]])
-            print 'construction liste classe %i' % i
-            self.tabprofile = ProfListctrlPanel(self.parent, self, DictProfile[str(i + 1)], Alceste, i + 1)
-            self.tabantiprofile = ProfListctrlPanel(self.parent, self, DictAnti[str(i + 1)], Alceste, i + 1)
+            self.tabprofile = ProfListctrlPanel(self.parent, self.panel, DictProfile[str(i + 1)], Alceste, i + 1)
+            #self.tabantiprofile = ProfListctrlPanel(self.parent, self, DictAnti[str(i + 1)], Alceste, i + 1)
             panel.ProfNB.AddPage(self.tabprofile, 'classe %s %s(%s%%)' % (str(i + 1), sep, indpour))
-            panel.AntiProfNB.AddPage(self.tabantiprofile, 'classe %s' % str(i + 1))
+            #panel.AntiProfNB.AddPage(self.tabantiprofile, 'classe %s' % str(i + 1))
             if os.path.exists(DictPathOut['prof_seg']) :
                 self.tab_prof_seg = ProfListctrlPanel(self.parent, self, prof_seg[str(i + 1)], False, i + 1)
                 self.prof_seg_nb.AddPage(self.tab_prof_seg, 'classe %i' % (i + 1))
 
        if clnb > 2 :
            self.TabAFC = aui.AuiNotebook(panel.TabChdSim, -1, wx.DefaultPosition)
-    
+           log.info('read AFC') 
            list_graph=read_list_file(DictPathOut['liste_graph_afc'], self.encoding)
            self.tabAFCGraph = GraphPanelAfc(self.TabAFC, DictPathOut, list_graph, self.clnb, coding=self.encoding)
            self.TabAFC.AddPage(self.tabAFCGraph, 'AFC')
@@ -363,13 +414,13 @@ class OpenCHDS():
            if os.path.exists(self.DictPathOut['afc_facteur']) :
                dictrow, first = ReadList(self.DictPathOut['afc_facteur'], self.encoding)
                self.TabAFC_facteur = ListForSpec(self.parent, parametres, dictrow, first)
-               dictrow, first = ReadList(self.DictPathOut['afc_row'], self.encoding)
-               self.TabAFC_ligne = ListForSpec(self.parent, self.parametres, dictrow, first)
-               dictrow, first = ReadList(self.DictPathOut['afc_col'], self.encoding)
-               self.TabAFC_colonne = ListForSpec(parent, self.parametres, dictrow, first)
+               #dictrow, first = ReadList(self.DictPathOut['afc_row'], self.encoding)
+               #self.TabAFC_ligne = ListForSpec(self.parent, self.parametres, dictrow, first)
+               #dictrow, first = ReadList(self.DictPathOut['afc_col'], self.encoding)
+               #self.TabAFC_colonne = ListForSpec(parent, self.parametres, dictrow, first)
                self.TabAFC.AddPage(self.TabAFC_facteur, 'Facteurs')
-               self.TabAFC.AddPage(self.TabAFC_colonne, u'Colonnes')
-               self.TabAFC.AddPage(self.TabAFC_ligne, u'Lignes')
+               #self.TabAFC.AddPage(self.TabAFC_colonne, u'Colonnes')
+               #self.TabAFC.AddPage(self.TabAFC_ligne, u'Lignes')
            
            sizer_3 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
            self.parent.nb_panel_2 = wx.Panel(panel.TabChdSim, -1)
@@ -382,22 +433,14 @@ class OpenCHDS():
            self.parent.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onsimi, self.parent.button_simi)
        
        panel.TabChdSim.AddPage(panel.ProfNB, 'Profils')
-       panel.TabChdSim.AddPage(panel.AntiProfNB, 'Antiprofils')
+       #panel.TabChdSim.AddPage(panel.AntiProfNB, 'Antiprofils')
        dlg.Update(4 + self.clnb, 'Affichage...')
        if clnb > 2 :
            panel.TabChdSim.AddPage(self.TabAFC, 'AFC')
        if os.path.exists(DictPathOut['prof_seg']) :
            panel.TabChdSim.AddPage(self.prof_seg_nb, u'Profils des segments répétés')
       
-       if isinstance(self.corpus, Corpus) :
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.on_export_classes, id = self.ID_export)
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onprofseg, id = self.ID_sg)
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.oncolored, id = self.ID_colored)
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onsearchf, id = self.ID_searchf)
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onproftype, id = self.ID_proftype)
-           panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onclusterstat, id = self.ID_clusterstat)
-
-       panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.ongetrapport, id = self.ID_rapport)
+#       panel.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.ongetrapport, id = self.ID_rapport)
        self.parent.nb.AddPage(panel, 'Classification - %s' % corpname)
        self.parent.ShowTab(True)
        self.parent.nb.SetSelection(self.parent.nb.GetPageCount() - 1)     
@@ -413,74 +456,76 @@ class OpenCHDS():
         outfile = print_simi3d(self)
         error = exec_rcode(self.parent.RPath, outfile, wait = True)
 
-    def ongetrapport(self, event) :
-        dial = PrefSimpleFile(self, self.parent, **{'mask' : '*.txt', 'title': 'Rapport'})
-        dial.fbb.SetValue(self.DictPathOut['rapport'])
-        dial.CenterOnParent()
-        res = dial.ShowModal()
-        if res == wx.ID_OK :
-            fileout = dial.fbb.GetValue()
-            dial.Destroy()
-            with open(fileout, 'w') as f :
-                f.write(self.debtext + '\n' + GetTxtProfile(self.DictProfile))
-            msg = u"Fini !"
-            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Rapport", wx.OK | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_INFORMATION)
-            dlg.CenterOnParent()
-            dlg.ShowModal()
-            dlg.Destroy()
-        else :
-            dial.Destroy()
+#    def ongetrapport(self, event) :
+#        dial = PrefSimpleFile(self, self.parent, **{'mask' : '*.txt', 'title': 'Rapport'})
+#        dial.fbb.SetValue(self.DictPathOut['rapport'])
+#        dial.CenterOnParent()
+#        res = dial.ShowModal()
+#        if res == wx.ID_OK :
+#            fileout = dial.fbb.GetValue()
+#            dial.Destroy()
+#            with open(fileout, 'w') as f :
+#                f.write(self.debtext + '\n' + GetTxtProfile(self.DictProfile, self.cluster_size))
+#            msg = u"Fini !"
+#            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Rapport", wx.OK | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_INFORMATION)
+#            dlg.CenterOnParent()
+#            dlg.ShowModal()
+#            dlg.Destroy()
+#        else :
+#            dial.Destroy()
 
-    def on_export_classes(self, event) :
-        corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
-        dial = PrefExport(self, self.parent)
-        dial.fbb.SetValue(os.path.join(os.path.dirname(corpus.dictpathout['ira']), 'export_corpus.txt'))
-        dial.CenterOnParent()
-        res = dial.ShowModal()
-        if res == wx.ID_OK :
-            if dial.radio_type.GetSelection() == 0 : alc = True
-            else : alc = False
-            if dial.radio_lem.GetSelection() == 0 : lem = True
-            else : lem = False
-            self.corpus.export_corpus_classes(dial.fbb.GetValue(), alc = alc, lem = lem)
-            msg = u"Fini !"
-            dial.Destroy()
-            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Export", wx.OK | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_INFORMATION)
-            dlg.CenterOnParent()
-            dlg.ShowModal()
-            dlg.Destroy()
+#    def on_export_classes(self, event) :
+#        corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
+#        dial = PrefExport(self, self.parent)
+#        dial.fbb.SetValue(os.path.join(os.path.dirname(corpus.dictpathout['ira']), 'export_corpus.txt'))
+#        dial.CenterOnParent()
+#        res = dial.ShowModal()
+#        if res == wx.ID_OK :
+#            if dial.radio_type.GetSelection() == 0 : alc = True
+#            else : alc = False
+#            if dial.radio_lem.GetSelection() == 0 : lem = True
+#            else : lem = False
+#            self.corpus.export_corpus_classes(dial.fbb.GetValue(), alc = alc, lem = lem)
+#            msg = u"Fini !"
+#            dial.Destroy()
+#            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Export", wx.OK | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_INFORMATION)
+#            dlg.CenterOnParent()
+#            dlg.ShowModal()
+#            dlg.Destroy()
 
-    def onprofseg(self, event):
-        try :
-            corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
-            ProfileSegment(self.parent,corpus)
-        except :
-            BugReport(self.parent)
-
-    def onproftype(self, event):
-        try :
-            corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
-            ProfilType(self.parent, corpus)
-        except :
-            BugReport(self.parent)
-
-    def oncolored(self,evt) :
-        dial = PrefSimpleFile(self, self.parent, **{'mask' : '*.html', 'title': 'Corpus en couleur'})
-        dial.fbb.SetValue(os.path.join(os.path.dirname(self.corpus.dictpathout['ira']), 'corpus_couleur.html'))
-        dial.CenterOnParent()
-        res = dial.ShowModal()
-        if res == wx.ID_OK :
-            fileout = dial.fbb.GetValue()
-            dial.Destroy()
-            txt = self.corpus.make_colored_corpus()
-            with open(fileout, 'w') as f :
-                f.write(txt)
-            msg = u"Fini !\nVoulez-vous ouvrir le corpus dans votre navigateur ?"
-            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Corpus en couleur", wx.NO | wx.YES | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_QUESTION)
-            dlg.CenterOnParent()
-            if dlg.ShowModal() == wx.ID_YES :
-                webbrowser.open(fileout)
-            dlg.Destroy()
+#    def onprofseg(self, event):
+#        #try :
+#            print 'plus de bug profseg'
+#            print self.parametres
+#            corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
+#            ProfileSegment(self.parent, self.dictpathout, self.parametres, corpus)
+#        #except :
+#        #    BugReport(self.parent)
+#
+#    def onproftype(self, event):
+#        try :
+#            corpus = self.parent.nb.GetPage(self.parent.nb.GetSelection()).corpus
+#            ProfilType(self.parent, corpus)
+#        except :
+#            BugReport(self.parent)
+#
+#    def oncolored(self,evt) :
+#        dial = PrefSimpleFile(self, self.parent, **{'mask' : '*.html', 'title': 'Corpus en couleur'})
+#        dial.fbb.SetValue(os.path.join(os.path.dirname(self.corpus.dictpathout['ira']), 'corpus_couleur.html'))
+#        dial.CenterOnParent()
+#        res = dial.ShowModal()
+#        if res == wx.ID_OK :
+#            fileout = dial.fbb.GetValue()
+#            dial.Destroy()
+#            txt = self.corpus.make_colored_corpus()
+#            with open(fileout, 'w') as f :
+#                f.write(txt)
+#            msg = u"Fini !\nVoulez-vous ouvrir le corpus dans votre navigateur ?"
+#            dlg = wx.MessageDialog(self.parent, msg, u"Corpus en couleur", wx.NO | wx.YES | wx.NO_DEFAULT | wx.ICON_QUESTION)
+#            dlg.CenterOnParent()
+#            if dlg.ShowModal() == wx.ID_YES :
+#                webbrowser.open(fileout)
+#            dlg.Destroy()
 
     def onclusterstat(self, evt) :
         dial = PrefSimpleFile(self, self.parent, **{'mask' : '*.csv', 'title': 'Stat par classe'})
@@ -498,14 +543,14 @@ class OpenCHDS():
             if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK :
                 dlg.Destroy()
 
-    def onsearchf(self, evt) :
-        if 'FrameSearch' not in dir(self.parent) :
-            self.parent.FrameSearch = SearchFrame(self.parent, -1, u"Rechercher...", self.corpus)
-        self.parent.FrameSearch.Show()
+    #def onsearchf(self, evt) :
+    #    if 'FrameSearch' not in dir(self.panel) :
+    #        self.panel.FrameSearch = SearchFrame(self.parent, -1, u"Rechercher...", self.corpus)
+    #    self.panel.FrameSearch.Show()
     
         
 
-def PrintRapport(self, corpus, parametres, txt = True):
+def PrintRapport(self, corpus, parametres, istxt = True):
     #if sys.platform == 'win32':
     #    sep = '\r\n'
     #else:
@@ -517,10 +562,10 @@ def PrintRapport(self, corpus, parametres, txt = True):
 
 
 """ % datetime.datetime.now().ctime()
-    totocc = corpus.gettotocc()
-    if txt :
-        txt += u'nombre d\'uci: %i%s' % (corpus.getucinb(), sep)
-        txt += u'nombre d\'uce: %i%s' % (corpus.getucenb(), sep)
+    if istxt :
+        totocc = corpus.gettotocc()
+        txt += u'nombre de textes: %i%s' % (corpus.getucinb(), sep)
+        txt += u'nombre de segments de textes: %i%s' % (corpus.getucenb(), sep)
         txt += u'nombre de formes: %i%s' % (len(corpus.formes), sep)
         txt += u'nombre d\'occurrences: %i%s' % (totocc, sep)
         txt += u'moyenne d\'occurrences par forme: %f%s' % (float(totocc) / float(len(self.corpus.formes)), sep)
@@ -530,31 +575,28 @@ def PrintRapport(self, corpus, parametres, txt = True):
         txt += u'nombre de formes actives de fréquence >= %i: %i%s' % (parametres['eff_min_forme'], parametres['nbactives'], sep)
         txt += u'moyenne d\'occurrences par uce :%f%s' % (float(totocc) / float(corpus.getucenb()), sep)
         if 'tailleuc1' in parametres :
-            if parametres['classif_mode'] != 0 :
-                txt += u'taille uc1 : %i\n' % parametres['tailleuc1']
-            else:
-                txt += u'taille uc1 / uc2: %i / %i - %i / %i%s' % (parametres['tailleuc1'], parametres['tailleuc2'], parametres['lenuc1'], parametres['lenuc2'], sep)
-    elif not txt :
+            if parametres['classif_mode'] == 0 :
+                txt += u'taille rst1 / rst2: %i / %i - %i / %i%s' % (parametres['tailleuc1'], parametres['tailleuc2'], parametres['lenuc1'], parametres['lenuc2'], sep)
+    else :
         self.Ucenb = self.nbind
         txt += u'nombre d\'individus : %i%s' % (self.nbind, sep)
         txt += u'nombre de classes : %i%s' % (self.clnb, sep)
-    if txt :
+    if istxt :
         txt += u'nombre de classes : %i%s' % (parametres['clnb'], sep)
         if parametres['classif_mode'] == 0 or parametres['classif_mode'] == 1 :
-            txt += u'%i uce classées sur %i (%.2f%%)%s' % (sum([len(cl) for cl in corpus.lc]), corpus.getucenb(), (float(sum([len(cl) for cl in corpus.lc])) / float(corpus.getucenb())) * 100, sep)
+            txt += u'%i segments classés sur %i (%.2f%%)%s' % (sum([len(cl) for cl in corpus.lc]), corpus.getucenb(), (float(sum([len(cl) for cl in corpus.lc])) / float(corpus.getucenb())) * 100, sep)
         elif self.parametres['classif_mode'] == 2 :
-            txt += u'%i uci classées sur %i (%.2f%%)%s' % (sum([len(cl) for cl in corpus.lc]), corpus.getucinb(), (float(sum([len(cl) for cl in corpus.lc]))) / float(corpus.getucinb()) * 100, sep)
-    elif analyse == 'quest' :
+            txt += u'%i textes classés sur %i (%.2f%%)%s' % (sum([len(cl) for cl in corpus.lc]), corpus.getucinb(), (float(sum([len(cl) for cl in corpus.lc]))) / float(corpus.getucinb()) * 100, sep)
+    else :
         txt += u'%i uce classées sur %i (%.2f%%)%s' % (self.ucecla, self.Ucenb, (float(self.ucecla) / float(self.Ucenb)) * 100, sep)
  
     txt += """
 ###########################
 temps d'analyse : %s
 ###########################
-""" % parametres['time']
-    file = open(self.pathout['pre_rapport'], 'w')
-    file.write(txt)
-    file.close()
+""" % parametres.get('time', '')
+    with open(self.pathout['pre_rapport'], 'w') as f :
+        f.write(txt)
 
 class dolexlayout :
     def __init__(self, ira, corpus, parametres):
@@ -607,7 +649,7 @@ class dolexlayout :
 
 class StatLayout:
     def __init__(self, ira, corpus, parametres):
-        self.pathout = PathOut(dirout = os.path.dirname(parametres['pathout']))
+        self.pathout = PathOut(dirout = parametres['pathout'])
         self.corpus = corpus
         self.ira = ira
         self.read_result()
@@ -648,12 +690,13 @@ class GraphPanelDendro(wx.Panel):
         self.dirout = os.path.dirname(self.dictpathout['ira'])
         self.list_graph = list_graph
         self.parent = self.GetParent()#parent
-        self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "courier"))
+        self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "Arial"))
         self.labels = []
         self.listimg = []
         self.tabchd = self.parent.GetParent()
         self.ira = self.tabchd.GetParent()
         self.panel_1 = wx.ScrolledWindow(self, -1, style=wx.TAB_TRAVERSAL)
+        self.panel_1.SetBackgroundColour('white')
         self.deb = wx.StaticText(self.panel_1, -1, txt)
         dendro_img = wx.Image(os.path.join(self.ira.images_path,'but_dendro.png'), wx.BITMAP_TYPE_ANY).ConvertToBitmap()
         self.butdendro = wx.BitmapButton(self, -1, dendro_img)
@@ -753,21 +796,7 @@ class GraphPanelDendro(wx.Panel):
             self.make_param(dial)
             self.make_dendro()
 
-class WordCloudLayout:
-    def __init__(self, ira, parent, filename):
-        self.dictpathout = parent.corpus.dictpathout
-        self.pathout = os.path.dirname(filename)
-        self.corpus = parent.corpus
-    #    self.read_result()
-        self.Tab = aui.AuiNotebook(ira.nb, -1, wx.DefaultPosition)
-        list_graph = [['nuage_1.png', 'Nuage']]
-        self.TabStatTot = GraphPanel(ira.nb, self.dictpathout, list_graph)
-        #self.TabStatTot.write(self.result['glob'])
-        self.Tab.AddPage(self.TabStatTot, 'Nuage')
-        self.Tab.corpus = parent.corpus
-        ira.nb.AddPage(self.Tab, 'WordCloud %s' % parent.conf.get('wordcloud','corpus_name'))
-        ira.nb.SetSelection(ira.nb.GetPageCount() - 1)
-        ira.ShowAPane("Tab_content")
+
 
 class OpenCorpus :
     def __init__(self, ira, parametres) :
@@ -849,10 +878,383 @@ class CopusPanel(wx.Panel) :
             text.Wrap( -1 )
             self.fgSizer5.Add( text, 0, wx.ALL, 5 )
 
-   # def read_result(self) :
-   #     #self.corpus.read_corpus_from_shelves(self.corpus.dictpathout['db'])
-   #     #self.corpus.make_et_table()
-   #     self.result = {}
-   #     with open(os.path.join(self.pathout,'glob.txt'), 'r') as f :
-   #         self.result['glob'] = f.read()
+class DefaultTextLayout :
+    def __init__(self, ira, corpus, parametres) :
+        self.pathout = PathOut(dirout = parametres['pathout'])
+        self.ira = ira
+        self.parent = ira
+        self.parametres = parametres
+        self.corpus = corpus
+        self.dolayout()
+    
+    def dolayout(self) :
+        log.info('no layout yet')
+
+class WordCloudLayout(DefaultTextLayout):
+    def dolayout(self):
+        #self.dictpathout = parent.corpus.dictpathout
+        #self.pathout = os.path.dirname(filename)
+        #self.corpus = parent.corpus
+    #    self.read_result()
+        self.pathout.basefiles(simipath)
+        self.Tab = aui.AuiNotebook(self.ira.nb, -1, wx.DefaultPosition)
+#        if os.path.exists(self.pathout['liste_graph']) :
+#            list_graph = read_list_file(self.pathout['liste_graph'])
+#        else : 
+#            list_graph = [['','']]
+        list_graph = [['nuage_1.png', 'Nuage']]
+        self.TabStatTot = GraphPanel(self.ira.nb, self.pathout, list_graph)
+        #self.TabStatTot.write(self.result['glob'])
+        self.Tab.AddPage(self.TabStatTot, 'Nuage')
+        self.Tab.corpus = self.corpus
+        self.Tab.parametres = self.parametres
+        self.ira.nb.AddPage(self.Tab, 'WordCloud %s' % self.parametres.get('corpus_name','corpus_name'))
+        self.ira.nb.SetSelection(self.ira.nb.GetPageCount() - 1)
+        self.ira.ShowAPane("Tab_content")
+
+class SimiLayout(DefaultTextLayout) :
+    def dolayout(self) :
+        self.pathout.basefiles(simipath)
+        self.actives = None
+        self.indices = indices_simi
+        if os.path.exists(self.pathout['liste_graph']) :
+            list_graph = read_list_file(self.pathout['liste_graph'])
+        else : 
+            list_graph = [['','']]
+        notebook_flags =  aui.AUI_NB_DEFAULT_STYLE | aui.AUI_NB_TAB_EXTERNAL_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_FLOAT
+        self.tabsimi = aui.AuiNotebook(self.ira.nb, -1, wx.DefaultPosition)
+        self.tabsimi.SetAGWWindowStyleFlag(notebook_flags)
+        self.tabsimi.SetArtProvider(aui.ChromeTabArt())
+        self.tabsimi.corpus = self.corpus
+        self.tabsimi.parametres = self.parametres
+        self.graphpan = GraphPanelSimi(self.tabsimi, self.pathout, list_graph)
+        self.graphpan.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.redosimi, self.graphpan.butafc)
+        self.graphpan.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.export, self.graphpan.butexport)
+        self.tabsimi.AddPage(self.graphpan, 'Graph')
+        self.ira.nb.AddPage(self.tabsimi, 'Analyse de graph')
+        self.ira.ShowTab(True)
+        self.ira.nb.SetSelection(self.ira.nb.GetPageCount() - 1)
+        
+    def redosimi(self, evt) :
+        with open(self.pathout['selected.csv'],'r') as f :
+            selected = f.read()
+        selected = [int(val) for val in selected.splitlines()]
+        if self.actives is None :
+            with codecs.open(self.pathout['actives.csv'], 'r', self.parametres['encoding']) as f :
+                self.actives = f.read()
+            self.actives = self.actives.splitlines()#[act for act in self.actives.splitlines()]
+        dictcol = dict([[i, [act, self.corpus.getlemeff(act)]] for i, act in enumerate(self.actives)])
+        #res = SelectColumn(self.ira, dictcol, self.actives, self.pathout['selected.csv'], selected = selected, dlg = True) 
+        #if res.ok :
+        prep = PrepSimi(self.ira, self, self.parametres,self.pathout['selected.csv'], self.actives, indices_simi, wordlist = dictcol, selected = selected)
+        if prep.val == wx.ID_OK :
+            self.parametres = prep.parametres
+
+            script = PrintSimiScript(self)
+            script.make_script()
+            pid = exec_rcode(self.ira.RPath, script.scriptout, wait = True)
+            check_Rresult(self.ira, pid)
+            if self.parametres['type_graph'] == 1:
+                if self.parametres['svg'] :
+                    filename, ext = os.path.splitext(script.filename)
+                    fileout = filename + '.svg'
+                else :
+                    fileout = script.filename
+                if os.path.exists(self.pathout['liste_graph']):
+                    graph_simi = read_list_file(self.pathout['liste_graph'])
+                    graph_simi.append([os.path.basename(fileout), script.txtgraph])
+                else :
+                    graph_simi = [[os.path.basename(fileout), script.txtgraph]]
+                print_liste(self.pathout['liste_graph'], graph_simi)
+            DoConf().makeoptions([self.parametres['type']], [self.parametres], self.pathout['Analyse.ira'])
+            if self.parametres['type_graph'] == 1:
+                if self.parametres['svg'] :
+                    self.graphpan.sizer_3.Add(hl.HyperLinkCtrl(self.graphpan.panel_1, -1, fileout, URL = fileout), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                else :
+                    self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticBitmap(self.graphpan.panel_1, -1, wx.Bitmap(fileout, wx.BITMAP_TYPE_ANY)), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticText(self.graphpan.panel_1,-1, script.txtgraph), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.graphpan.sizer_3.Fit(self.graphpan.panel_1)
+                self.graphpan.Layout()
+                self.graphpan.panel_1.Scroll(0,self.graphpan.panel_1.GetScrollRange(wx.VERTICAL))
+
+    def export(self, evt) :
+        nb = 1
+        while os.path.exists(os.path.join(self.pathout.dirout,'graph_'+str(nb)+'.graphml')):
+            nb +=1
+        fileout = ffr(os.path.join(self.pathout.dirout,'graph_'+str(nb)+'.graphml'))
+        txt = """
+        library(igraph)
+        load("%s")
+        fileout <- "%s"
+        graph <- graph.simi$graph
+        V(graph)$x <- graph.simi$layout[,1]
+        V(graph)$y <- graph.simi$layout[,2]
+        V(graph)$weight <- graph.simi$label.cex
+        V(graph)$colors <- cols
+        E(graph)$weigth <- graph.simi$we.width
+        write.graph(graph, fileout, format = 'graphml')
+        """ % (self.pathout['RData.RData'], fileout)
+        filetmp = tempfile.mktemp()
+        with open(filetmp, 'w') as f :
+            f.write(txt)
+        exec_rcode(self.ira.RPath, filetmp)
+        mss = wx.MessageDialog(self.ira, fileout, u'Fichier exporté', wx.OK)
+        mss.CenterOnParent()
+        mss.ShowModal()
+        mss.Destroy()
+
+class DefaultMatLayout :
+    def __init__(self, parent, tableau, parametres) :
+        self.pathout = PathOut(dirout = parametres['pathout'])
+        self.ira = parent
+        self.parent = parent
+        self.tableau = tableau
+        self.parametres = parametres
+        self.dolayout()
+
+    def dolayout(self) :
+        pass
+
+class SimiMatLayout(DefaultMatLayout) :
+    def dolayout(self):
+        self.pathout.basefiles(simipath)
+        self.indices = indices_simi
+        if os.path.exists(self.pathout['liste_graph']) :
+            list_graph = read_list_file(self.pathout['liste_graph'])
+        else : 
+            list_graph = [['','']]
+        notebook_flags =  aui.AUI_NB_DEFAULT_STYLE | aui.AUI_NB_TAB_EXTERNAL_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_MOVE | aui.AUI_NB_TAB_FLOAT
+        self.tabsimi = aui.AuiNotebook(self.parent.nb, -1, wx.DefaultPosition)
+        self.tabsimi.SetAGWWindowStyleFlag(notebook_flags)
+        self.tabsimi.SetArtProvider(aui.ChromeTabArt())
+        self.graphpan = GraphPanelSimi(self.tabsimi, self.pathout, list_graph)
+        self.graphpan.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.redosimi, self.graphpan.butafc)
+        #self.graphpan.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.export, self.graphpan.butexport)
+        self.tabsimi.AddPage(self.graphpan, 'Graph')
+        self.tabsimi.parametres = self.parametres
+        self.parent.nb.AddPage(self.tabsimi, 'Analyse de graph')
+        self.parent.ShowTab(True)
+        self.parent.nb.SetSelection(self.parent.nb.GetPageCount() - 1)
+
+    def redosimi(self,evt) :
+        with open(self.pathout['selected.csv'],'r') as f :
+            selected = f.read()
+        selected = [int(val) for val in selected.splitlines()]
+        #if self.actives is None :
+        #    with codecs.open(self.pathout['actives.csv'], 'r', self.parametres['encoding']) as f :
+        #        self.actives = f.read()
+        #    self.actives = self.actives.splitlines()#[act for act in self.actives.splitlines()]
+        actives = [[val, self.tableau.actives[val][0]] for val in self.tableau.actives]
+        #self.tableau.make_listactives()
+        actives = dict([[i, val] for i, val in enumerate(actives)])
+        #dictcol = dict([[i, [act, self.corpus.getlemeff(act)]] for i, act in enumerate(self.actives)])
+        self.dial = PrefSimi(self.parent, -1, self.parametres, self.indices, wordlist = actives, selected = selected, actives = self.tableau.listactives)
+        self.dial.CenterOnParent()
+        self.val = self.dial.ShowModal()
+        if self.val == wx.ID_OK :
+            last = self.dial.listcol.GetFirstSelected()
+            lastl = [self.dial.listcol.GetFirstSelected()]
+            indexes = [self.dial.listcol.getColumnText(self.dial.listcol.GetFirstSelected(),0)]
+            while self.dial.listcol.GetNextSelected(last) != -1:
+                last = self.dial.listcol.GetNextSelected(last)
+                lastl.append(last)
+                indexes.append(self.dial.listcol.getColumnText(last,0))
+            self.column = [self.tableau.listactives.index(val) for val in indexes]
+            self.column.sort()
+            with open(self.pathout['selected.csv'], 'w') as f :
+                f.write('\n'.join([`val` for val in self.column]))
+            self.make_param()
+            self.dial.Destroy()
+            self.script = PrintSimiScript(self)
+            self.script.make_script()
+            self.tmpfile = self.script.scriptout
+            dlg = progressbar(self, maxi = 2)
+            self.DoR(dlg)
+            dlg.Destroy()
+            if self.parametres['type_graph'] == 1:
+                if self.parametres['svg'] :
+                    filename, ext = os.path.splitext(self.script.filename)
+                    fileout = filename + '.svg'
+                else :
+                    fileout = self.script.filename
+                if os.path.exists(self.pathout['liste_graph']):
+                    graph_simi = read_list_file(self.pathout['liste_graph'])
+                    graph_simi.append([os.path.basename(fileout), self.script.txtgraph])
+                else :
+                    graph_simi = [[os.path.basename(fileout), self.script.txtgraph]]
+                print_liste(self.pathout['liste_graph'], graph_simi)            
+            DoConf().makeoptions([self.parametres['type']], [self.parametres], self.pathout['Analyse.ira'])
+            if self.parametres['type_graph'] == 1:
+                if self.parametres['svg'] :
+                    self.graphpan.sizer_3.Add(hl.HyperLinkCtrl(self.graphpan.panel_1, -1, fileout, URL = fileout), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                else :
+                    self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticBitmap(self.graphpan.panel_1, -1, wx.Bitmap(self.script.filename, wx.BITMAP_TYPE_ANY)), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticText(self.graphpan.panel_1,-1, self.script.txtgraph), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+                self.graphpan.sizer_3.Fit(self.graphpan.panel_1)
+                self.graphpan.Layout()
+                self.graphpan.panel_1.Scroll(0,self.graphpan.panel_1.GetScrollRange(wx.VERTICAL))
+        else :
+            self.dial.Destroy()
+               
+
+    def make_param(self) :
+        if self.parametres['first'] :
+            keep_coord = False
+        else :
+            keep_coord = self.dial.check_coord.GetValue()
+        #self.select = self.dial.check_colch.GetValue()
+
+        paramsimi = {'coeff' : self.dial.choice1.GetSelection(),
+                          'layout' : self.dial.choice2.GetSelection(),
+                          'type_graph' : self.dial.choice3.GetSelection(),
+                          'arbremax' : self.dial.check1.GetValue(),
+                          'coeff_tv' : self.dial.check_s_size.GetValue(),
+                          'coeff_tv_nb' : self.dial.spin_tv.GetValue(),
+                          'tvprop' : self.dial.check2.GetValue(),
+                          'tvmin' : self.dial.spin_tvmin.GetValue(),
+                          'tvmax' : self.dial.spin_tvmax.GetValue(),
+                          'coeff_te' : self.dial.check3.GetValue(),
+                          'coeff_temin' : self.dial.spin_temin.GetValue(),
+                          'coeff_temax' : self.dial.spin_temax.GetValue(),
+                          'label_e' : self.dial.check_elab.GetValue(),
+                          'label_v' : self.dial.check_vlab.GetValue(),
+                          'vcex' : self.dial.check_vcex.GetValue(),
+                          'vcexmin' : self.dial.spin_vcexmin.GetValue(),
+                          'vcexmax' : self.dial.spin_vcexmax.GetValue(),
+                          'cex' : self.dial.spin_cex.GetValue(),
+                          'seuil_ok' : self.dial.check_seuil.GetValue(),
+                          'seuil' : self.dial.spin_seuil.GetValue(),
+                          'cols' : self.dial.cols.GetColour(),
+                          'cola' : self.dial.cola.GetColour(),
+                          'width' : self.dial.spin_width.GetValue(),
+                          'height' : self.dial.spin_height.GetValue(),
+                          'first' : False,
+                          'keep_coord' : keep_coord,
+                          'alpha' : self.dial.slider_sphere.GetValue(),
+                          'film' : self.dial.film.GetValue(),
+                          'svg' : self.dial.choix_format.GetSelection(),
+                          'halo' : self.dial.halo.GetValue(),
+                          'com' : self.dial.comcheck.GetValue(),
+                          'communities' : self.dial.choix_com.GetSelection(),
+                          }        
+        if 'cexfromchi' in self.parametres :
+            paramsimi['cexfromchi'] = self.dial.checkit.GetValue()
+        if 'sfromchi' in self.parametres :
+            paramsimi['sfromchi'] = self.dial.checki.GetValue()
+        if 'vlabcolor' in self.parametres :
+           paramsimi['vlabcolor'] = self.parametres['vlabcolor']
+        if 'check_bystar' in dir(self.dial) :
+            paramsimi['bystar'] = self.dial.check_bystar.GetValue()
+            paramsimi['stars'] = self.parametres['stars']
+        self.parametres.update(paramsimi)
 
+    def DoR(self, dlg):
+        if self.parametres['type_graph'] == 1 :
+            graph = False
+            wait = False
+        else : 
+            graph = True
+            wait = True
+        pid = exec_rcode(self.parent.RPath, self.tmpfile, wait = wait, graph = graph)
+        if self.parametres['type_graph'] == 1 :
+            while pid.poll() == None :
+                dlg.Pulse(u'R ...')
+                sleep(0.2)
+            check_Rresult(self.parent, pid)
+    
+        #return paramsimi
+
+#        if self.openfromprof :
+#            if 'cexfromchi' not in self.paramsimi:
+#                self.paramsimi['cexfromchi'] = False
+#                self.paramsimi['sfromchi'] = False
+#        self.dial = PrefSimi(self.parent, -1, self.paramsimi, self.types)
+#        self.dial.CenterOnParent()
+#        val = self.dial.ShowModal()
+#        if val == wx.ID_OK :
+#            self.paramsimi = self.make_param()
+#            self.dial.Destroy()
+#            if self.paramsimi.get('bystar',False) :
+#                variables = treat_var_mod(self.paramsimi['stars'])
+#                dial = OptLexi(self.parent)
+#                dial.listet = self.paramsimi['stars']
+#                var = [v for v in variables]
+#                dial.variables = var
+#                for et in var :
+#                    dial.list_box_1.Append(et)
+#                dial.CenterOnParent()
+#                val = dial.ShowModal()
+#                if val == wx.ID_OK :
+#                    if dial.choice.GetSelection() == 1 :
+#                        listet = [dial.listet[i] for i in dial.list_box_1.GetSelections()]
+#                    else :
+#                        listet = variables[var[dial.list_box_1.GetSelections()[0]]]
+#                    self.tableau.etline = self.Source.corpus.make_etline(listet)
+#
+#            dlg = wx.ProgressDialog("Traitements",
+#                                    "Veuillez patienter...",
+#                                     maximum=2,
+#                                     parent=self.parent,
+#                                     style=wx.PD_APP_MODAL | wx.PD_AUTO_HIDE | wx.PD_ELAPSED_TIME | wx.PD_CAN_ABORT)
+#            dlg.Center()
+#            self.PrintScript()
+#            self.DoR(dlg)
+#            dlg.Destroy()
+#            self.make_ira()
+#            if self.paramsimi['type'] == 1:
+#                self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticBitmap(self.graphpan.panel_1, -1, wx.Bitmap(self.filename, wx.BITMAP_TYPE_ANY)), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+#                self.graphpan.sizer_3.Add(wx.StaticText(self.graphpan.panel_1,-1,self.txtgraph), 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+#                self.graphpan.sizer_3.Fit(self.graphpan.panel_1)
+#                self.graphpan.Layout()
+#                self.graphpan.panel_1.Scroll(0,self.graphpan.panel_1.GetScrollRange(wx.VERTICAL))
+#        else :
+#            self.dial.Destroy()
+
+        
+class GraphPanelSimi(wx.Panel):
+    def __init__(self,parent, dico, list_graph):
+        wx.Panel.__init__(self,parent)
+        self.afcnb = 1
+        self.Dict = dico
+        self.dirout = os.path.dirname(self.Dict['ira'])
+        self.parent = self.GetParent()#parent
+        self.SetFont(wx.Font(10, wx.DEFAULT, wx.NORMAL, wx.NORMAL, 0, "courier"))
+        self.labels = []
+        self.listimg = []
+        self.tabsimi = self.parent.GetParent()
+        self.ira = self.tabsimi.GetParent()
+        self.panel_1 = wx.ScrolledWindow(self, -1, style=wx.TAB_TRAVERSAL)
+        afc_img = wx.Image(os.path.join(self.ira.images_path,'button_simi.jpg'), wx.BITMAP_TYPE_ANY).ConvertToBitmap()
+        self.butafc = wx.BitmapButton(self, -1, afc_img)
+        export_img = wx.Image(os.path.join(self.ira.images_path,'button_export.jpg'), wx.BITMAP_TYPE_ANY).ConvertToBitmap()
+        self.butexport = wx.BitmapButton(self, -1, export_img)
+        for i in range(0,len(list_graph)):
+            if os.path.exists(os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0])) :
+                filename, ext = os.path.splitext(list_graph[i][0])
+                if ext == '.svg' :
+                    self.listimg.append(hl.HyperLinkCtrl(self.panel_1, -1, os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0]), URL=os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0])))
+                else :
+                    self.listimg.append(wx.StaticBitmap(self.panel_1, -1, wx.Bitmap(os.path.join(self.dirout,list_graph[i][0]), wx.BITMAP_TYPE_ANY)))
+                self.labels.append(wx.StaticText(self.panel_1, -1, list_graph[i][1]))
+                
+        self.__set_properties()
+        self.__do_layout()
+
+    def __set_properties(self):
+        self.panel_1.EnableScrolling(True,True)
+        #self.panel_1.SetSize((1000,1000))
+        self.panel_1.SetScrollRate(20, 20)
+
+    def __do_layout(self):    
+        self.sizer_1 = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
+        self.sizer_2 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
+        self.sizer_3 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
+        self.sizer_2.Add(self.butafc, 0, 0, 0)
+        self.sizer_2.Add(self.butexport, 0, 0, 0)
+        for i in range(0, len(self.listimg)):
+            self.sizer_3.Add(self.listimg[i], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+            self.sizer_3.Add(self.labels[i], 0, wx.ALIGN_CENTER_HORIZONTAL, 0)
+        self.panel_1.SetSizer(self.sizer_3)
+        self.sizer_1.Add(self.sizer_2, 0, wx.EXPAND, 0)
+        self.sizer_1.Add(self.panel_1, 1, wx.EXPAND, 0)
+        self.SetSizer(self.sizer_1)