X-Git-Url: http://iramuteq.org/git?p=iramuteq;a=blobdiff_plain;f=Rscripts%2FCHD.R;h=68edd4e848d9af2d2527d14ac82998d38305afc0;hp=049d5c7badcd3f5ffe733e61373ad3f858b7fd2c;hb=8347c52224950bb01c725f9efdeee8631f8d4052;hpb=13666be5de5eeffbe63774c3c0aecd407b519ac6

diff --git a/Rscripts/CHD.R b/Rscripts/CHD.R
index 049d5c7..68edd4e 100644
--- a/Rscripts/CHD.R
+++ b/Rscripts/CHD.R
@@ -1,6 +1,6 @@
 #Author: Pierre Ratinaud
 #Copyright (c) 2008-2011 Pierre Ratinaud
-#Lisense: GNU/GPL
+#License: GNU/GPL
 
 pp<-function(txt,val) {
 	d<-paste(txt,' : ')
@@ -26,22 +26,37 @@ find.max <- function(dtable, chitable, compte, rmax, maxinter, sc, TT) {
     lo[1:nrow(dtable)] <- 0
     for (k in 1:nrow(ln)) {lo[[ln[k,1]]]<-append(lo[[ln[k,1]]],ln[k,2])}
     for (k in 1:nrow(dtable)) {lo[[k]] <- lo[[k]][-1]}
-    lo<-lo[-c(1,length(lo))]
-    for (l in lo) {
-        compte <- compte + 1 
-        chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
-        chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
-        chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
-        if (chi>maxinter) {
-            maxinter<-chi
-            rmax<-compte
-        }   
-    }
+	## lo<-lo[-c(1,length(lo))]
+	## for (l in lo) {
+	##     compte <- compte + 1 
+	##     chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
+	##     chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
+	##     chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
+		## if (chi>maxinter) {
+		##     maxinter<-chi
+		##     rmax<-compte
+		## }   
+    #}
+	lo<-lo[-c(1)]
+	for (l in lo) {
+		chi<-MyChiSq(chitable,sc,TT)
+		if (chi>maxinter) {
+			maxinter<-chi
+			rmax<-compte
+		}
+		compte <- compte + 1
+		chitable[1,l]<-chitable[1,l]+1
+		chitable[2,l]<-chitable[2,l]-1
+	}	
     res <- list(maxinter=maxinter, rmax=rmax)
     res
 }  
 
-CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, libsvdc=FALSE, libsvdc.path=NULL){
+
+
+
+
+CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, svd.method, libsvdc.path=NULL){
 #	sink('/home/pierre/workspace/iramuteq/dev/findchi2.txt')
 	dataori <- data.in
     row.names(dataori) <- rownames(data.in)
@@ -78,7 +93,7 @@ CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, libsvdc=FALSE, libsvdc.path=NUL
 		#extraction du premier facteur de l'afc
 		print('afc')
 		pp('taille dtable dans boucle (col/row)',c(ncol(dtable),nrow(dtable)))
-		afc<-boostana(dtable, nd=1, libsvdc=libsvdc, libsvdc.path=libsvdc.path)
+		afc<-boostana(dtable, nd=1, svd.method = svd.method, libsvdc.path=libsvdc.path)
 		pp('SV',afc$singular.values)
 		pp('V.P.', afc$eigen.values)
 		coordrow <- as.matrix(afc$row.scores[,1])
@@ -103,7 +118,7 @@ CHD<-function(data.in, x=9, mode.patate = FALSE, libsvdc=FALSE, libsvdc.path=NUL
         rmax <- NULL
 
         inert <- find.max(dtable, chitable, compte, rmax, maxinter, sc, TT)
-		print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
+        print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
 		pp('max inter phase 1', inert$maxinter/TT)#max(listinter))
 		print('@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@')
         ordert <- ordert[order(ordert[,3]),]