...
authorPierre <ratinaud@univ-tlse2.fr>
Thu, 30 Aug 2012 15:26:35 +0000 (17:26 +0200)
committerPierre <ratinaud@univ-tlse2.fr>
Thu, 30 Aug 2012 15:26:35 +0000 (17:26 +0200)
13 files changed:
PrintRScript.py
analysetxt.py
corpusNG.py
dictionnaires/expression_fr.txt
functions.py
iracmd.py
iramuteq.py
openanalyse.py
tabsimi.py
textaslexico.py
textsimi.py
textstat.py
tree.py

index 4d0fb40..6089847 100644 (file)
@@ -17,6 +17,7 @@ class PrintRScript :
         log.info('Rscript')
         self.pathout = analyse.pathout
         self.analyse = analyse
         log.info('Rscript')
         self.pathout = analyse.pathout
         self.analyse = analyse
+        self.parametres = analyse.parametres
         self.scriptout = self.pathout['temp']
         self.script =  u"#Script genere par IRaMuTeQ - %s" % datetime.now().ctime()
     
         self.scriptout = self.pathout['temp']
         self.script =  u"#Script genere par IRaMuTeQ - %s" % datetime.now().ctime()
     
index f5d9273..666a062 100644 (file)
@@ -78,8 +78,8 @@ class AnalyseText :
             minutes, seconds = divmod(self.time, 60)
             hours, minutes = divmod(minutes, 60)            
             self.parametres['time'] = '%.0fh %.0fm %.0fs' % (hours, minutes, seconds)
             minutes, seconds = divmod(self.time, 60)
             hours, minutes = divmod(minutes, 60)            
             self.parametres['time'] = '%.0fh %.0fm %.0fs' % (hours, minutes, seconds)
-            self.parametres['ira'] = self.pathout['ira']
-            DoConf().makeoptions([self.parametres['type']], [self.parametres], self.pathout['ira'])
+            self.parametres['ira'] = self.pathout['Analyse.ira']
+            DoConf().makeoptions([self.parametres['type']], [self.parametres], self.pathout['Analyse.ira'])
             self.ira.history.add(self.parametres)
             if dlg :
                 dlg.Destroy()
             self.ira.history.add(self.parametres)
             if dlg :
                 dlg.Destroy()
index f1c8451..eb55b08 100644 (file)
@@ -54,6 +54,7 @@ class Corpus :
         self.idformesuces = {}
         self.iduces = None
         self.idformes = None
         self.idformesuces = {}
         self.iduces = None
         self.idformes = None
+        self.uceuci = None
         if read :
             self.pathout = PathOut(dirout = parametres['pathout'])
             self.read_corpus()
         if read :
             self.pathout = PathOut(dirout = parametres['pathout'])
             self.read_corpus()
@@ -221,6 +222,10 @@ class Corpus :
 #            else :
 #                    self.lems[self.formes[forme].lem] = {self.formes[forme].ident : 0}
 
 #            else :
 #                    self.lems[self.formes[forme].lem] = {self.formes[forme].ident : 0}
 
+    def getetbyuceid(self, uceid) :
+        if self.uceuci is None : self.uceuci = dict([[uce.ident,uci.ident] for uci in self.ucis for uce in uci.uces])
+        return self.ucis[self.uceuci[uceid]].etoiles
+
     def make_lems(self, lem = True) :
         log.info('make lems')
         self.lems = {}
     def make_lems(self, lem = True) :
         log.info('make lems')
         self.lems = {}
@@ -527,6 +532,64 @@ class Corpus :
         self.lc0 = self.lc.pop(0)
         #return ucecl
 
         self.lc0 = self.lc.pop(0)
         #return ucecl
 
+    def gethapaxbyet(self, etoiles) :
+        hapaxuces = [self.getlemuces(forme)[0] for forme in self.lems if self.lems[forme].freq == 1]
+        hucesdict = {}
+        for uce in hapaxuces :
+            if uce in hucesdict :
+                hucesdict[uce] += 1
+            else :
+                hucesdict[uce] = 1
+        etuces = [[] for et in etoiles]
+        for uci in self.ucis :
+            get = list(set(uci.etoiles).intersection(etoiles))
+            if len(get) > 1 :
+                return '2 variables sur la meme ligne'
+            elif get != [] :
+                etuces[etoiles.index(get[0])] += [uce.ident for uce in uci.uces]
+        etuces = [set(val) for val in etuces]
+        return [sum([hucesdict[uce] for uce in list(etuce.intersection(hapaxuces))]) for etuce in etuces]
+
+    def gethapaxuces(self) :
+        hapaxuces = [self.getlemuces(forme)[0] for forme in self.lems if self.lems[forme].freq == 1]
+        hapax = [forme for forme in self.lems if self.lems[forme].freq == 1]
+        hucesdict = {}
+        for i,uce in enumerate(hapaxuces) :
+            if uce in hucesdict :
+                hucesdict[uce][0] += 1
+                hucesdict[uce][1].append(hapax[i])
+            else :
+                hucesdict[uce] = [1,[hapax[i]]]
+        huces = {}
+        for uce in hucesdict :
+            if hucesdict[uce][0] in huces :
+                huces[hucesdict[uce][0]].append(uce)
+            else :
+                huces[hucesdict[uce][0]] = [uce]
+        huces = zip(huces, huces.values())
+        huces.sort(reverse=True)
+        txt = """
+        <html><body>
+        """
+        for nb in huces[0:4] :
+            txt += "<p><h2>%i hapax par uce</h2><p>\n" % nb[0]
+            for uce in nb[1] :
+                res = self.getconcorde([uce])
+                for row in res :
+                    ucetxt = ' ' + row[1] + ' '
+                    uceid = row[0]
+                for hap in hucesdict[uce][1] :
+                    laforme = self.getforme([forme for forme in self.lems[hap].formes][0]).forme
+                    ucetxt = ucetxt.replace(' '+laforme+' ', ' <font color=red>'+laforme+'</font> ')
+                txt += '<p><b>' + ' '.join(self.getetbyuceid(uceid)) + '</b></p>'
+                txt += '<p>'+ucetxt+'</p>\n'
+        txt += """
+        </body></html>
+        """
+        with open('/tmp/testhapxuce.html','w') as f :
+            f.write(txt)
+
+
 class Uci :
     def __init__(self, iduci, line, paraset = None) :
         self.ident = iduci
 class Uci :
     def __init__(self, iduci, line, paraset = None) :
         self.ident = iduci
@@ -630,7 +693,7 @@ def prep_txtcharact(txt) :
 
 class BuildCorpus :
     """
 
 class BuildCorpus :
     """
-    Class for building a corpora
+    Class for building a corpus
     """
     def __init__(self, infile, parametres_corpus, lexique = None, expressions = None, dlg = None) :
         log.info('begin building corpus...')
     """
     def __init__(self, infile, parametres_corpus, lexique = None, expressions = None, dlg = None) :
         log.info('begin building corpus...')
index ca3ce2d..ecbb0b7 100644 (file)
@@ -3,7 +3,6 @@ a cappella      a_cappella      ADV                     0.04    0.07    0.04    0.07
 a contrario    a_contrario     ADV                     0       0.27    0       0.27    
 a fortiori     a_fortiori      ADV                     0.04    0.88    0.04    0.88    
 a giorno       a_giorno        ADV                     0       0.27    0       0.27    
 a contrario    a_contrario     ADV                     0       0.27    0       0.27    
 a fortiori     a_fortiori      ADV                     0.04    0.88    0.04    0.88    
 a giorno       a_giorno        ADV                     0       0.27    0       0.27    
-a jeun à_jeun ADV                     1.45    3.85    0.18    0       
 a l'instar     a_l_instar      PRE                     0.26    0       0.26    0       
 a posteriori   a_posteriori    ADV                     0.05    0.2     0.01    0.14    
 ab absurdo     ab_absurdo      ADV                     0       0.07    0       0.07    
 a l'instar     a_l_instar      PRE                     0.26    0       0.26    0       
 a posteriori   a_posteriori    ADV                     0.05    0.2     0.01    0.14    
 ab absurdo     ab_absurdo      ADV                     0       0.07    0       0.07    
index 3922fd5..2165f33 100644 (file)
@@ -71,6 +71,7 @@ class History :
         sections = self.corpora.keys() + self.analyses.keys()
         parametres = [self.corpora[key] for key in self.corpora.keys()] + [self.analyses[key] for key in self.analyses.keys()]
         self.conf.makeoptions(sections, parametres)
         sections = self.corpora.keys() + self.analyses.keys()
         parametres = [self.corpora[key] for key in self.corpora.keys()] + [self.analyses[key] for key in self.analyses.keys()]
         self.conf.makeoptions(sections, parametres)
+        log.info('write history')
 
     def add(self, analyse) :
         if 'corpus' in analyse :
 
     def add(self, analyse) :
         if 'corpus' in analyse :
@@ -87,6 +88,19 @@ class History :
             self.corpora[analyse['uuid']] = analyse
         self.write()
 
             self.corpora[analyse['uuid']] = analyse
         self.write()
 
+    def delete(self, uuid, corpus = False) :
+        if corpus :
+            del self.corpora[uuid]
+            self.conf.conf.remove_section(uuid)
+            for analyse in self.history[uuid].get('analyses', [False]) :
+                if analyse :
+                    del self.analyses[analyse['uuid']]
+                    self.conf.conf.remove_section(analyse['uuid'])
+        else :
+            del self.analyses[uuid]
+            self.conf.conf.remove_section(uuid)
+        self.write()
+
     def addtab(self, analyse) :
         self.opened[analyse['uuid']] = analyse
 
     def addtab(self, analyse) :
         self.opened[analyse['uuid']] = analyse
 
@@ -133,6 +147,7 @@ class DoConf :
                     self.conf.set(section, option, parametres[i][option].encode('utf8'))
         if outfile is None :
             outfile = self.configfile
                     self.conf.set(section, option, parametres[i][option].encode('utf8'))
         if outfile is None :
             outfile = self.configfile
+        print outfile
         with codecs.open(outfile, 'w', 'utf8') as f :
             self.conf.write(f)
 
         with codecs.open(outfile, 'w', 'utf8') as f :
             self.conf.write(f)
 
index deba7cf..19b0880 100644 (file)
--- a/iracmd.py
+++ b/iracmd.py
@@ -100,7 +100,10 @@ class CmdLine :
 
 
             corpus.conn_all()
 
 
             corpus.conn_all()
+            corpus.make_lems()
             corpus.parse_active(gramact, gramsup)
             corpus.parse_active(gramact, gramsup)
+            log.warning('ATTENTION gethapaxuces')
+            corpus.gethapaxuces()
                 #    self.content = f.read()
                 #self.content = self.content.replace('\r','')
             if options.type_analyse == 'alceste' :
                 #    self.content = f.read()
                 #self.content = self.content.replace('\r','')
             if options.type_analyse == 'alceste' :
index 0abc480..db25305 100644 (file)
@@ -844,14 +844,15 @@ Voulez-vous fermer quand même ?"""
         except:
             BugReport(self)
 
         except:
             BugReport(self)
 
-    def OnSimiTxt(self, evt) :
-        #    print 'PLUS DE BUG SUR SIMITXT'
-        try :
-            self.Text = SimiTxt(self)
+    def OnSimiTxt(self, evt, corpus = None) :
+            print 'PLUS DE BUG SUR SIMITXT'
+        #try :
+            #self.Text = SimiTxt(self)
+            self.Text = SimiTxt(self, corpus, parametres = {'type': 'simitxt'}, dlg = progressbar(self, 3))
             if self.Text.val == wx.ID_OK :
                 PlaySound(self)
             if self.Text.val == wx.ID_OK :
                 PlaySound(self)
-        except :
-            BugReport(self)
+        #except :
+        #    BugReport(self)
     
     def OnWordCloud(self, evt) :
         #    print 'PLUS DE BUG SUR WORDCLOUD'
     
     def OnWordCloud(self, evt) :
         #    print 'PLUS DE BUG SUR WORDCLOUD'
index da4a75d..1cf1a03 100644 (file)
@@ -60,7 +60,18 @@ class OpenAnalyse():
         elif self.conf['type'] == 'alceste' :
             self.parent.ShowMenu(_("Text analysis"))
             OpenCHDS(self.parent,  corpus, self.conf, Alceste = True)
         elif self.conf['type'] == 'alceste' :
             self.parent.ShowMenu(_("Text analysis"))
             OpenCHDS(self.parent,  corpus, self.conf, Alceste = True)
-        elif self.conf['type'] == 'simi' :
+        elif self.conf['type'] == 'simitxt' :
+            self.tableau = Tableau(self.parent, self.conf['ira'])
+            self.DictPathOut=construct_simipath(self.conf['pathout'])
+            self.tableau.dictpathout = self.DictPathOut
+            self.tableau.read_tableau(self.tableau.dictpathout['db'])
+            if self.tableau.parametre.get('corpus', False) :
+                self.corpus=corpus
+                #self.corpus.read_corpus_from_shelves(self.DictPathOut['corpus'])
+                self.corpus.parametres['openpath'] = self.conf['pathout']
+                self.parent.ShowMenu(_("Text analysis"))
+            DoSimi(self.parent, self.conf, isopen = True, filename = self.conf['ira'], gparent = self, openfromprof=False) 
+            
             print 'simi'
 #        try :
 #            #if self.conf['type'] in ['analyse','lexico','stat','wordcloud'] :
             print 'simi'
 #        try :
 #            #if self.conf['type'] in ['analyse','lexico','stat','wordcloud'] :
index faf8631..53974aa 100644 (file)
@@ -16,6 +16,8 @@ import tempfile
 import datetime
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from time import sleep
 import datetime
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from time import sleep
+from uuid import uuid4
+
 
 class DoSimi():
     def __init__(self, parent, param = None, isopen = False, fromprof = False, pathout = False, filename ='', gparent = False, wordgraph = False, listactives = False, actives = False, cmd = False, openfromprof=False):
 
 class DoSimi():
     def __init__(self, parent, param = None, isopen = False, fromprof = False, pathout = False, filename ='', gparent = False, wordgraph = False, listactives = False, actives = False, cmd = False, openfromprof=False):
@@ -226,6 +228,9 @@ class DoSimi():
         if not 'simi' in conf.sections() :
             conf.add_section('simi')
         date = datetime.datetime.now().ctime()
         if not 'simi' in conf.sections() :
             conf.add_section('simi')
         date = datetime.datetime.now().ctime()
+        if self.fromprof :
+            conf.set('simi', 'corpus', self.Source.corpus.parametres['uuid'])
+        conf.set('simi', 'uuid', str(uuid4()))
         conf.set('simi', 'date', str(date))
         conf.set('simi', 'indice', self.paramsimi['coeff'])
         conf.set('simi','layout', self.paramsimi['layout'])
         conf.set('simi', 'date', str(date))
         conf.set('simi', 'indice', self.paramsimi['coeff'])
         conf.set('simi','layout', self.paramsimi['layout'])
index 82311cd..d78c8fd 100644 (file)
@@ -17,6 +17,9 @@ import tempfile
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from guifunct import getPage, getCorpus
 from time import sleep
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from guifunct import getPage, getCorpus
 from time import sleep
+import logging
+
+log = logging.getLogger('iramuteq.spec')
 
 class Lexico(AnalyseText) :
     def doanalyse(self) :
 
 class Lexico(AnalyseText) :
     def doanalyse(self) :
@@ -275,7 +278,20 @@ class Lexico(AnalyseText) :
         mineff = self.parametres['mineff']
         #dlg = progressbar(self, maxi = 3)
         tabout = self.corpus.make_lexitable(mineff, self.listet)
         mineff = self.parametres['mineff']
         #dlg = progressbar(self, maxi = 3)
         tabout = self.corpus.make_lexitable(mineff, self.listet)
+        log.warning('Fmax a 200')
+        Fmax = [line for line in tabout[1:] if sum(line[1:]) > 199]
+        formesmax = [line[0] for line in Fmax]
+        Fmax = [line[1:] for line in Fmax]
+        summax = [sum(col) for col in zip(*Fmax)]
+        tabout.append(['Fmax'] + summax)
+        tabout = [line for line in tabout if line[0] not in formesmax]
+        log.warning('ATTENTION : hapax par etoile')
+        tabout.append(['hapax'] + self.corpus.gethapaxbyet(self.listet))
         write_tab(tabout, self.dictpathout['tableafcm'])
         write_tab(tabout, self.dictpathout['tableafcm'])
+        
+        #log.warning('ATTENTION : gethapaxuces')
+        #self.corpus.gethapaxuces()
+
         tabout = self.corpus.make_efftype_from_etoiles(self.listet)
         write_tab(tabout, self.dictpathout['tabletypem'])
         #dlg.Update(2, u'R...')
         tabout = self.corpus.make_efftype_from_etoiles(self.listet)
         write_tab(tabout, self.dictpathout['tabletypem'])
         #dlg.Update(2, u'R...')
index 1340276..efd3a67 100644 (file)
@@ -6,24 +6,50 @@
 from chemins import ConstructPathOut, construct_simipath
 from corpus import Corpus
 import os
 from chemins import ConstructPathOut, construct_simipath
 from corpus import Corpus
 import os
+from analysetxt import AnalyseText
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from guifunct import getPage, getCorpus
 from dialog import StatDialog
 from functions import indices_simi, progressbar, treat_var_mod
 from tableau import Tableau
 from tabsimi import DoSimi
 from ConfigParser import RawConfigParser
 from guifunct import getPage, getCorpus
 from dialog import StatDialog
 from functions import indices_simi, progressbar, treat_var_mod
 from tableau import Tableau
 from tabsimi import DoSimi
+from PrintRScript import PrintRScript
 import wx
 from copy import copy
 
 import wx
 from copy import copy
 
-class SimiTxt :
-    def __init__(self, parent, cmd = False, param = None):
-        self.parent = parent
-        self.cmd = cmd
-        self.ConfigPath = parent.ConfigPath
-        self.DictPath = parent.DictPath
-        self.KeyConf = RawConfigParser()
-        self.KeyConf.read(self.ConfigPath['key'])
+import logging
+
+logger = logging.getLogger('iramuteq.textsimi')
+
+
+
+class SimiTxt(AnalyseText): 
+    def doanalyse(self) :
         self.indices = indices_simi
         self.indices = indices_simi
+        self.makesimiparam()
+        self.makefiles()
+        prep = PrepSimi(self.ira, self.parametres, indices_simi)
+        self.parametres = prep.parametres
+        script = PrintSimScript(self)
+
+
+    def preferences(self) :
+        dial = StatDialog(self, self.parent)
+        dial.CenterOnParent()
+        val = dial.ShowModal()
+        if val == 5100 :
+            if dial.radio_lem.GetSelection() == 0 :
+                lem = 1
+            else :
+                lem = 0            
+            self.parametres['lem'] = lem
+            dial.Destroy()
+            return self.parametres
+        else :
+            dial.Destroy()
+            return None
+
+    def makesimiparam(self) :
         self.paramsimi = {'coeff' : 0,
                           'layout' : 2,
                           'type' : 1,
         self.paramsimi = {'coeff' : 0,
                           'layout' : 2,
                           'type' : 1,
@@ -54,117 +80,313 @@ class SimiTxt :
                           'keep_coord' : True,
                           'alpha' : 20,
                           'film': False,
                           'keep_coord' : True,
                           'alpha' : 20,
                           'film': False,
+                          #'ira' : self.pathout['Analyse.ira']
                           }
                           }
-        page = getPage(self.parent)
-        if page is not None :
-            self.corpus = getCorpus(page)
-            if self.corpus is not None :
-                self.pathout = ConstructPathOut(self.corpus.parametre['openpath'], 'simitxt')
-                self.dictpathout = construct_simipath(self.pathout)
-                self.val = wx.ID_OK
-                self.make_table()
-                self.make_simi()
+        self.parametres.update(self.paramsimi)
+
+    def makefiles(self) :
+        self.actives, lim = self.corpus.make_actives_nb(self.parametres.get('max_actives',1500), 1)
+        self.parametres['eff_min_forme'] = lim
+        self.parametres['nbactives'] = len(self.actives)
+        self.parametres['fromprof'] = True
+        self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uces(self.actives, self.pathout['mat01.csv'], self.pathout['listeuce1.csv'])
+        with open(self.pathout['actives.csv'], 'w') as f :
+            f.write('\n'.join(self.actives).encode(self.ira.syscoding))
+
+        self.listet = self.corpus.make_etoiles()
+        self.listet.sort()
+        self.parametres['stars'] = copy(self.listet)
+        self.parametres['sfromchi'] = False
+
+class PrepSimi :
+    def _init_(self, parent, parametres, indices_simi) :    
+        self.parametres = parametres
+        self.dial = PrefSimi(parent, -1, self.parametres, indices_simi) 
+        self.dial.CenterOnParent()
+        self.val = self.dial.ShowModal()
+        if self.val == wx.ID_OK :
+            self.make_param()
+
+    def make_param(self) :
+        self.select = self.dial.check_colch.GetValue()
+        param = {'coeff' : self.dial.choice1.GetSelection(),
+                          'layout' : self.dial.choice2.GetSelection(),
+                          'type' : self.dial.choice3.GetSelection(),
+                          'arbremax' : self.dial.check1.GetValue(),
+                          'coeff_tv' : self.dial.check_s_size.GetValue(),
+                          'coeff_tv_nb' : self.dial.spin_tv.GetValue(),
+                          'tvprop' : self.dial.check2.GetValue(),
+                          'tvmin' : self.dial.spin_tvmin.GetValue(),
+                          'tvmax' : self.dial.spin_tvmax.GetValue(),
+                          'coeff_te' : self.dial.check3.GetValue(),
+                          'coeff_temin' : self.dial.spin_temin.GetValue(),
+                          'coeff_temax' : self.dial.spin_temax.GetValue(),
+                          'label_e' : self.dial.check_elab.GetValue(),
+                          'label_v' : self.dial.check_vlab.GetValue(),
+                          'vcex' : self.dial.check_vcex.GetValue(),
+                          'vcexmin' : self.dial.spin_vcexmin.GetValue(),
+                          'vcexmax' : self.dial.spin_vcexmax.GetValue(),
+                          'cex' : self.dial.spin_cex.GetValue(),
+                          'seuil_ok' : self.dial.check_seuil.GetValue(),
+                          'seuil' : self.dial.spin_seuil.GetValue(),
+                          'cols' : self.dial.cols.GetColour(),
+                          'cola' : self.dial.cola.GetColour(),
+                          'width' : self.dial.spin_width.GetValue(),
+                          'height' : self.dial.spin_height.GetValue(),
+                          'first' : False,
+                          'keep_coord' : keep_coord,
+                          'alpha' : self.dial.slider_sphere.GetValue(),
+                          'film' : self.dial.film.GetValue()
+                          }
+        if 'cexfromchi' in self.parametres :
+            param['cexfromchi'] = self.dial.checkit.GetValue()
+        if 'sfromchi' in self.parametres :
+            param['sfromchi'] = self.dial.checki.GetValue()
+        if 'vlabcolor' in self.parametres :
+           param['vlabcolor'] = self.parametres['vlabcolor']
+        if 'check_bystar' in dir(self.dial) :
+            param['bystar'] = self.dial.check_bystar.GetValue()
+            param['stars'] = self.parametres['stars']
+        self.parametres.update(param)
+
+class PrintSimiScript(PrintRScript) :
+    def make_script(self) :
+        self.load(['igraph', 'proxy', 'Matrix'])
+        self.source([self.analyse.parent.RscriptsPath['simi'], self.analyse.parent.RscriptsPath['Rgraph']])
+        txt = """
+        dm.path <- "%s"
+        cn.path <- "%s"
+        selected.col <- "%s"
+        """ % (self.pathout['mat01.csv'], self.pathout['actives.csv'], self.pathout['selected.csv'])
+        
+        txt += """
+        dm <- dm[, selected.col+1]
+        """
+        if self.parametres['coeff'] == 0 :
+            method = 'cooc'
+            txt += """
+            method <- 'cooc'
+            mat <- make.a(dm)
+            """
         else :
         else :
-            self.corpus = Corpus(parent)
-            self.corpus.content = self.parent.content
-            self.corpus.parametre['encodage'] = parent.corpus_encodage
-            self.corpus.parametre['lang'] = parent.corpus_lang
-            self.corpus.parametre['filename'] = parent.filename
-            self.corpus.parametre['eff_min_uce'] = None
-            self.pathout = ConstructPathOut(self.corpus.parametre['filename'], 'simitxt')
-            self.dictpathout = construct_simipath(self.pathout)
-            dial = StatDialog(self, self.parent)
-            dial.check_uce.SetValue(True)
-            dial.check_uce.Enable(False)
-            dial.OnCheckUce(wx.EVT_MENU)
-            self.val = dial.ShowModal()
-            if self.val == wx.ID_OK :
-                with open(self.parent.ConfigPath['key'], 'w') as f:
-                    self.KeyConf.write(f)
-                if dial.radio_lem.GetSelection() == 0 : lem = True
-                else : lem = False
-                if dial.exp.GetSelection() == 0 : exp = True
-                else : exp = False
-                dial.Destroy()
-                self.corpus.parametre['lem'] = lem
-                self.corpus.parametre['expressions'] = exp
-                self.corpus.parametre['nbforme_uce'] = dial.spin_ctrl_4.GetValue()
-                self.corpus.parametre['eff_min_forme'] = dial.spin_ctrl_5.GetValue()
-                self.corpus.parametre['max_actives'] = dial.spin_max_actives.GetValue()
-                self.make_corpus()
-                self.make_table()
-                self.make_simi()
-            else :
-                dial.Destroy()
-
-    def make_corpus(self) :
-        print 'make corpus'
-        if not self.cmd :
-            dlg = progressbar(self, maxi = 6)
-        self.corpus.supplementaires = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "2"]
-        self.corpus.typeactive = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "1"]
-        ucis_txt, ucis_paras_txt = self.corpus.start_analyse(self.parent, dlg = dlg, cmd = self.cmd)
-        del ucis_txt
-    
-        if not self.cmd :
-            dlg.Update(5, '%i ucis - Construction des uces' % len(ucis_paras_txt))
-        self.corpus.make_ucis_paras_uces(ucis_paras_txt, make_uce = True)
-        del ucis_paras_txt
-
-        if self.corpus.para_coords != [[] for val in self.corpus.para_coords] :
-            self.corpus.parametre['para'] = True
+            txt += """
+            dm <- as.matrix(dm)
+            """
+        if self.parametres['coeff'] == 1 :
+            method = 'prcooc'
+            txt += """
+            method <- 'Russel'
+            mat <- simil(dm, method = 'Russel', diag = TRUE, upper = TRUE, by_rows = FALSE)
+            """
+        elif self.analyses.indices[self.parametres['coeff']] == 'binomial' :
+            method = 'binomial'
+            txt += """
+            method <- 'binomial'
+            mat <- binom.sim(dm)
+            """
         else :
         else :
-            self.corpus.parametre['para'] = False
-        self.corpus.make_etoiles(self.corpus.para_coords)
-        print 'len(ucis_paras_uces)', len(self.corpus.ucis_paras_uces)
-
-        if not self.cmd :
-            dlg.Update(6, u'Dictionnaires')
-        uces, self.orderuces = self.corpus.make_forms_and_uces()
-        self.corpus.ucenb = len(uces)
-        self.corpus.make_lems(self.parent.lexique)
-
-        self.corpus.make_var_actives() 
-        self.corpus.make_var_supp()
-        self.corpus.lems_eff = self.corpus.make_lem_eff()
-
-        #variables = treat_var_mod(listet)
-        #print(variables)
-        #self.corpus.write_etoiles(self.dictpathout['etoiles'])
-        if not self.cmd :
-            dlg.Destroy()
-                
-    def make_table(self) :
-        if 'orderuces' not in dir(self) :
-            self.orderuces = [(i,j,k) for i, uci in enumerate(self.corpus.ucis_paras_uces) for j, para in enumerate(uci) for k, uce in enumerate(para)]
-            self.orderuces = dict([[val, i] for i, val in enumerate(self.orderuces)])
-            self.corpus.ucenb = len(self.orderuces)
-        #tabuc1 = self.corpus.make_table_with_uce(self.orderuces)
-        #tabuc1.insert(0,self.corpus.actives)
-        #tabuc1 = self.corpus.make_sparse_matrix_with_uce(self.orderuces)
-        #self.corpus.write_sparse_matrix(self.dictpathout['mat01'], tabuc1, self.corpus.ucenb, len(self.corpus.actives))
-        if self.corpus.actives is None :
-            self.corpus.typeactive = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "1"]
-            self.corpus.min_eff_formes()
-            self.corpus.make_var_actives()
-        self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uce(self.orderuces, self.dictpathout['mat01'])
-        #self.corpus.write_tab(tabuc1,self.dictpathout['mat01'])
-
-    def make_simi(self) :
+            method = self.types[self.paramsimi['coeff']]
+            txt += """
+            method <-"%s"
+            mat <- simil(dm, method = method, diag = TRUE, upper = TRUE, by_rows = FALSE)
+            """ % self.analyse.indices[self.parametres['coeff']]
+        txt += """
+        mat <- as.matrix(stats::as.dist(mat,diag=TRUE,upper=TRUE))
+        mat[is.na(mat)] <- 0
+        mat[is.infinite(mat)] <- 0
+        """
+        if self.parametres['layout'] == 0 : layout = 'random'
+        if self.parametres['layout'] == 1 : layout = 'circle'
+        if self.parametres['layout'] == 2 : layout = 'frutch'
+        if self.parametres['layout'] == 3 : layout = 'kawa'
+        if self.parametres['layout'] == 4 : layout = 'graphopt'
+        
+        txt += """
+        eff <- colSums(dm)
+        g.ori <- graph.adjacency(mat, mode='lower', weighted = TRUE)
+        w.ori <- E(g.ori)$weight
+        if (max.tree) {
+            if (method == 'cooc') {
+                E(g.ori)$weight <- 1 / w.ori
+            } else {
+                E(g.ori)$weigth <- 1 - w.ori
+            }
+            g.max <- minimum.spanning.tree(g.ori)
+            if (method == 'cooc') {
+                E(g.max)$weight <- 1 / E(g.max)$weight
+            } else {
+                E(g.max)$weight <- 1 - E(g.max)$weight
+            }
+            g.toplot <- g.max
+        } else {
+            g.toplot <- g.ori
+        }
+        """
+            
+
+
         self.tableau = Tableau(self.parent, '')
         self.tableau = Tableau(self.parent, '')
-        self.tableau.listactives = self.corpus.actives
+        self.tableau.listactives = self.actives
         self.tableau.parametre['fromtxt'] = True
         self.tableau.parametre['fromtxt'] = True
-        if 'lems_eff' not in dir(self.corpus) :
-            self.corpus.lems_eff = self.corpus.make_lem_eff()
+        self.corpus.lems_eff = dict([[lem,[self.corpus.lems[lem].freq]] for lem in self.actives])
         #print('ATTENTION  ETOILES')
         #self.paramsimi['bystar'] = True
         #print('ATTENTION  ETOILES')
         #self.paramsimi['bystar'] = True
-        self.listet = self.corpus.get_unique_etoiles()
-        self.listet.sort()
         self.tableau.listet = copy(self.listet)
         self.tableau.listet = copy(self.listet)
-        self.paramsimi['stars'] = copy(self.listet)
         #self.paramsimi['cexfromchi'] = True
         #self.paramsimi['cexfromchi'] = True
-        self.paramsimi['sfromchi'] = False
         #self.paramsimi['vlabcolor'] = True
         #self.paramsimi['vlabcolor'] = True
-        self.tableau.actives = dict([[lem, self.corpus.lems_eff[lem]] for lem in self.corpus.actives])
-        self.corpus.save_corpus(self.dictpathout['corpus']) 
-        DoSimi(self, fromprof = self.dictpathout['mat01'], param = self.paramsimi, pathout = self.pathout)
+        self.tableau.actives = copy(self.corpus.lems_eff)
+        DoSimi(self, fromprof = self.pathout['mat01.csv'], param = self.paramsimi, pathout = self.pathout.dirout)
+
+#class SimiTxt :
+#    def __init__(self, parent, cmd = False, param = None):
+#        self.parent = parent
+#        self.cmd = cmd
+#        self.ConfigPath = parent.ConfigPath
+#        self.DictPath = parent.DictPath
+#        self.KeyConf = RawConfigParser()
+#        self.KeyConf.read(self.ConfigPath['key'])
+#        self.indices = indices_simi
+#        self.paramsimi = {'coeff' : 0,
+#                          'layout' : 2,
+#                          'type' : 1,
+#                          'arbremax' : 1,
+#                          'coeff_tv' : 1,
+#                          'coeff_tv_nb' : 0,
+#                          'tvprop' : 0,
+#                          'tvmin' : 5,
+#                          'tvmax' : 30,
+#                          'coeff_te' : 1,
+#                          'coeff_temin' : 1,
+#                          'coeff_temax' : 10,
+#                          'label_v': 1,
+#                          'label_e': 0,
+#                          'vcex' : 1,
+#                          'cexfromchi' : False,
+#                          'vcexmin' : 10,
+#                          'vcexmax' : 25,
+#                          'cex' : 10,
+#                          'seuil_ok' : 0,
+#                          'seuil' : 1,
+#                          'cols' : (255,0,0),
+#                          'cola' : (200,200,200),
+#                          'width' : 1000,
+#                          'height' : 1000,
+#                          'bystar' : False,
+#                          'first' : True,
+#                          'keep_coord' : True,
+#                          'alpha' : 20,
+#                          'film': False,
+#                          }
+#        page = getPage(self.parent)
+#        if page is not None :
+#            self.corpus = getCorpus(page)
+#            if self.corpus is not None :
+#                self.pathout = ConstructPathOut(self.corpus.parametre['openpath'], 'simitxt')
+#                self.dictpathout = construct_simipath(self.pathout)
+#                self.val = wx.ID_OK
+#                self.make_table()
+#                self.make_simi()
+#        else :
+#            self.corpus = Corpus(parent)
+#            self.corpus.content = self.parent.content
+#            self.corpus.parametre['encodage'] = parent.corpus_encodage
+#            self.corpus.parametre['lang'] = parent.corpus_lang
+#            self.corpus.parametre['filename'] = parent.filename
+#            self.corpus.parametre['eff_min_uce'] = None
+#            self.pathout = ConstructPathOut(self.corpus.parametre['filename'], 'simitxt')
+#            self.dictpathout = construct_simipath(self.pathout)
+#            dial = StatDialog(self, self.parent)
+#            dial.check_uce.SetValue(True)
+#            dial.check_uce.Enable(False)
+#            dial.OnCheckUce(wx.EVT_MENU)
+#            self.val = dial.ShowModal()
+#            if self.val == wx.ID_OK :
+#                with open(self.parent.ConfigPath['key'], 'w') as f:
+#                    self.KeyConf.write(f)
+#                if dial.radio_lem.GetSelection() == 0 : lem = True
+#                else : lem = False
+#                if dial.exp.GetSelection() == 0 : exp = True
+#                else : exp = False
+#                dial.Destroy()
+#                self.corpus.parametre['lem'] = lem
+#                self.corpus.parametre['expressions'] = exp
+#                self.corpus.parametre['nbforme_uce'] = dial.spin_ctrl_4.GetValue()
+#                self.corpus.parametre['eff_min_forme'] = dial.spin_ctrl_5.GetValue()
+#                self.corpus.parametre['max_actives'] = dial.spin_max_actives.GetValue()
+#                self.make_corpus()
+#                self.make_table()
+#                self.make_simi()
+#            else :
+#                dial.Destroy()
+#
+#    def make_corpus(self) :
+#        print 'make corpus'
+#        if not self.cmd :
+#            dlg = progressbar(self, maxi = 6)
+#        self.corpus.supplementaires = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "2"]
+#        self.corpus.typeactive = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "1"]
+#        ucis_txt, ucis_paras_txt = self.corpus.start_analyse(self.parent, dlg = dlg, cmd = self.cmd)
+#        del ucis_txt
+#    
+#        if not self.cmd :
+#            dlg.Update(5, '%i ucis - Construction des uces' % len(ucis_paras_txt))
+#        self.corpus.make_ucis_paras_uces(ucis_paras_txt, make_uce = True)
+#        del ucis_paras_txt
+#
+#        if self.corpus.para_coords != [[] for val in self.corpus.para_coords] :
+#            self.corpus.parametre['para'] = True
+#        else :
+#            self.corpus.parametre['para'] = False
+#        self.corpus.make_etoiles(self.corpus.para_coords)
+#        print 'len(ucis_paras_uces)', len(self.corpus.ucis_paras_uces)
+#
+#        if not self.cmd :
+#            dlg.Update(6, u'Dictionnaires')
+#        uces, self.orderuces = self.corpus.make_forms_and_uces()
+#        self.corpus.ucenb = len(uces)
+#        self.corpus.make_lems(self.parent.lexique)
+#
+#        self.corpus.make_var_actives() 
+#        self.corpus.make_var_supp()
+#        self.corpus.lems_eff = self.corpus.make_lem_eff()
+#
+#        #variables = treat_var_mod(listet)
+#        #print(variables)
+#        #self.corpus.write_etoiles(self.dictpathout['etoiles'])
+#        if not self.cmd :
+#            dlg.Destroy()
+#                
+#    def make_table(self) :
+#        if 'orderuces' not in dir(self) :
+#            self.orderuces = [(i,j,k) for i, uci in enumerate(self.corpus.ucis_paras_uces) for j, para in enumerate(uci) for k, uce in enumerate(para)]
+#            self.orderuces = dict([[val, i] for i, val in enumerate(self.orderuces)])
+#            self.corpus.ucenb = len(self.orderuces)
+#        #tabuc1 = self.corpus.make_table_with_uce(self.orderuces)
+#        #tabuc1.insert(0,self.corpus.actives)
+#        #tabuc1 = self.corpus.make_sparse_matrix_with_uce(self.orderuces)
+#        #self.corpus.write_sparse_matrix(self.dictpathout['mat01'], tabuc1, self.corpus.ucenb, len(self.corpus.actives))
+#        if self.corpus.actives is None :
+#            self.corpus.typeactive = [option for option in self.KeyConf.options('KEYS') if self.KeyConf.get('KEYS', option) == "1"]
+#            self.corpus.min_eff_formes()
+#            self.corpus.make_var_actives()
+#        self.corpus.make_and_write_sparse_matrix_from_uce(self.orderuces, self.dictpathout['mat01'])
+#        #self.corpus.write_tab(tabuc1,self.dictpathout['mat01'])
+#
+#    def make_simi(self) :
+#        self.tableau = Tableau(self.parent, '')
+#        self.tableau.listactives = self.corpus.actives
+#        self.tableau.parametre['fromtxt'] = True
+#        if 'lems_eff' not in dir(self.corpus) :
+#            self.corpus.lems_eff = self.corpus.make_lem_eff()
+#        #print('ATTENTION  ETOILES')
+#        #self.paramsimi['bystar'] = True
+#        self.listet = self.corpus.get_unique_etoiles()
+#        self.listet.sort()
+#        self.tableau.listet = copy(self.listet)
+#        self.paramsimi['stars'] = copy(self.listet)
+#        #self.paramsimi['cexfromchi'] = True
+#        self.paramsimi['sfromchi'] = False
+#        #self.paramsimi['vlabcolor'] = True
+#        self.tableau.actives = dict([[lem, self.corpus.lems_eff[lem]] for lem in self.corpus.actives])
+#        self.corpus.save_corpus(self.dictpathout['corpus']) 
+#        DoSimi(self, fromprof = self.dictpathout['mat01'], param = self.paramsimi, pathout = self.pathout)
index 4d67879..bf28af1 100644 (file)
@@ -1,7 +1,7 @@
 #!/bin/env python
 # -*- coding: utf-8 -*-
 #Author: Pierre Ratinaud
 #!/bin/env python
 # -*- coding: utf-8 -*-
 #Author: Pierre Ratinaud
-#Copyright (c) 2008-2009 Pierre Ratinaud
+#Copyright (c) 2008-2012 Pierre Ratinaud
 #Lisense: GNU/GPL
 
 #from chemins import ConstructPathOut, StatTxtPathOut, ffr
 #Lisense: GNU/GPL
 
 #from chemins import ConstructPathOut, StatTxtPathOut, ffr
@@ -67,6 +67,8 @@ class Stat(AnalyseText) :
         supp = [[forme, formes[forme].freq, formes[forme].gram] for forme in formes if formes[forme].act == 2]        
         supp = sortedby(supp, 2, 1)
 
         supp = [[forme, formes[forme].freq, formes[forme].gram] for forme in formes if formes[forme].act == 2]        
         supp = sortedby(supp, 2, 1)
 
+        #print self.corpus.gethapaxbyuci()
+
         supp = [[i, val] for i, val in enumerate(supp)]
         #self.corpus.pathout = self.dictpathout
         #self.corpus.make_type_tot()
         supp = [[i, val] for i, val in enumerate(supp)]
         #self.corpus.pathout = self.dictpathout
         #self.corpus.make_type_tot()
diff --git a/tree.py b/tree.py
index 41769f5..aac691a 100644 (file)
--- a/tree.py
+++ b/tree.py
@@ -50,10 +50,6 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
         self.count = 0
         self.log = log
 
         self.count = 0
         self.log = log
 
-        # NOTE:  For some reason tree items have to have a data object in
-        #        order to be sorted.  Since our compare just uses the labels
-        #        we don't need any real data, so we'll just use None below for
-        #        the item data.
         self.history = parent.history
         self.h = self.history.history
         self.root = self.AddRoot("Iramuteq")
         self.history = parent.history
         self.h = self.history.history
         self.root = self.AddRoot("Iramuteq")
@@ -319,15 +315,17 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
             alceste = classification.Append(wx.ID_ANY, u"Méthode ALCESTE")
             pam = classification.Append(wx.ID_ANY, u"Par matrice des distances")
             menu.AppendMenu(-1, u"Classification", classification)
             alceste = classification.Append(wx.ID_ANY, u"Méthode ALCESTE")
             pam = classification.Append(wx.ID_ANY, u"Par matrice des distances")
             menu.AppendMenu(-1, u"Classification", classification)
+            simi = menu.Append(wx.ID_ANY, u"Analyse de similitude")
             menu.AppendSeparator()
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnAlceste, alceste)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnPam, pam)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnStat, stat)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnSpec, spec)
             menu.AppendSeparator()
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnAlceste, alceste)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnPam, pam)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnStat, stat)
             self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnSpec, spec)
+            self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnSimiTxt, simi)
 
 
-        item10 = menu.Append(wx.ID_ANY, "Supprimer de l'historique")
+        itemdelete = menu.Append(wx.ID_ANY, "Supprimer de l'historique")
         if item == self.GetRootItem():
         if item == self.GetRootItem():
-            item10.Enable(False)
+            itemdelete.Enable(False)
         #item11 = menu.Append(wx.ID_ANY, "Prepend An Item")
         #item12 = menu.Append(wx.ID_ANY, "Append An Item")
 
         #item11 = menu.Append(wx.ID_ANY, "Prepend An Item")
         #item12 = menu.Append(wx.ID_ANY, "Append An Item")
 
@@ -340,7 +338,7 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnDisableItem, item7)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemIcons, item8)
         self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemInfo, info)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnDisableItem, item7)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemIcons, item8)
         self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemInfo, info)
-        #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemDelete, item10)
+        self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemDelete, itemdelete)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemPrepend, item11)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemAppend, item12)
         
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemPrepend, item11)
         #self.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnItemAppend, item12)
         
@@ -365,6 +363,9 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
     def OnPam(self, evt) :
         print 'rien'
 
     def OnPam(self, evt) :
         print 'rien'
 
+    def OnSimiTxt(self, evt) :
+        self.parent.OnSimiTxt(evt, self.getcorpus(self.itemdict))
+
     def OnItemBackground(self, event):
 
         colourdata = wx.ColourData()
     def OnItemBackground(self, event):
 
         colourdata = wx.ColourData()
@@ -495,7 +496,12 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
             return
 
         dlg.Destroy()
             return
 
         dlg.Destroy()
-
+        
+        pydata = self.itemdict['pydata']
+        if 'corpus_name' in pydata :
+            self.history.delete(pydata['uuid'], True)
+        else :
+            self.history.delete(pydata['uuid'])
         self.DeleteChildren(self.current)
         self.Delete(self.current)
         self.current = None
         self.DeleteChildren(self.current)
         self.Delete(self.current)
         self.current = None
@@ -647,13 +653,14 @@ class LeftTree(CT.CustomTreeCtrl):
     def OnSelChanged(self, event):
         item = event.GetItem()
         pydata = self.GetPyData(item)
     def OnSelChanged(self, event):
         item = event.GetItem()
         pydata = self.GetPyData(item)
-        if pydata['uuid'] in self.parent.history.opened :
-            for i in range(self.parent.nb.GetPageCount()) :
-                page = self.parent.nb.GetPage(i)
-                if 'parametres' in dir(page) :
-                    if page.parametres['uuid'] == pydata['uuid'] :
-                        self.parent.nb.SetSelection(i)
-                        break
+        if pydata is not None :
+            if pydata['uuid'] in self.parent.history.opened :
+                for i in range(self.parent.nb.GetPageCount()) :
+                    page = self.parent.nb.GetPage(i)
+                    if 'parametres' in dir(page) :
+                        if page.parametres['uuid'] == pydata['uuid'] :
+                            self.parent.nb.SetSelection(i)
+                            break
 
         #self.item = event.GetItem()
         #if self.item:
 
         #self.item = event.GetItem()
         #if self.item: