...
authorPierre <ratinaud@univ-tlse2.fr>
Thu, 20 Dec 2012 11:08:05 +0000 (12:08 +0100)
committerPierre <ratinaud@univ-tlse2.fr>
Thu, 20 Dec 2012 11:08:05 +0000 (12:08 +0100)
PrintRScript.py
Rscripts/Rgraph.R
Rscripts/afc_graph.R
analysetxt.py

index 4ce2857..8d85e71 100644 (file)
@@ -207,7 +207,7 @@ def RchdTxt(DicoPath, RscriptPath, mincl, classif_mode, nbt = 9, libsvdc = False
     save(tree.cut1, file="%s")
     classes<-n1[,ncol(n1)]
     open_file_graph("%s", width = 600, height=400)
-    plot.dendropr(tree.cut1$tree.cl,classes)
+    plot.dendropr(tree.cut1$tree.cl,classes, histo=TRUE)
     open_file_graph("%s", width = 600, height=400)
     plot(tree.cut1$dendro_tot_cl)
     dev.off()
@@ -366,33 +366,37 @@ write.csv2(gbcluster,file="%s")
         """ % (DictChdTxtOut['afc_facteur'], DictChdTxtOut['afc_col'], DictChdTxtOut['afc_row'])
     
         txt += """
-        xlab <- paste('facteur 1 - ', round(afc$facteur[1,2],2), sep = '')
-        ylab <- paste('facteur 2 - ', round(afc$facteur[2,2],2), sep = '')
-        xlab <- paste(xlab, ' %', sep = '')
-        ylab <- paste(ylab, ' %', sep = '')
+        #xlab <- paste('facteur 1 - ', round(afc$facteur[1,2],2), sep = '')
+        #ylab <- paste('facteur 2 - ', round(afc$facteur[2,2],2), sep = '')
+        #xlab <- paste(xlab, ' %', sep = '')
+        #ylab <- paste(ylab, ' %', sep = '')
         """
     
         txt += """
     PARCEX<-%s
+    xmin <- min(afc$rowcoord[,1]) + (0.1 * min(afc$rowcoord[,1]))
+    xmax <- max(afc$rowcoord[,1]) + (0.1 * max(afc$rowcoord[,1]))
+    ymin <- min(afc$rowcoord[,2]) + (0.1 * min(afc$rowcoord[,2]))
+    ymax <- max(afc$rowcoord[,2]) + (0.1 * max(afc$rowcoord[,2]))
     """ % taillecar
         txt += """
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=1, fin=(debsup-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
+    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=1, fin=(debsup-1), xlab = xlab, ylab = ylab, xmin=xmin, xmax=xmax, ymin = ymin, ymax=ymax)
     """ % (DictChdTxtOut['AFC2DL_OUT'])
         txt += """
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=debsup, fin=(debet-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
+    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=debsup, fin=(debet-1), xlab = xlab, ylab = ylab, xmin=xmin, xmax=xmax, ymin = ymin, ymax=ymax)
     """ % (DictChdTxtOut['AFC2DSL_OUT'])
         txt += """
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=debet, fin=fin, xlab = xlab, ylab = ylab)
+    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='coord', deb=debet, fin=fin, xlab = xlab, ylab = ylab, xmin=xmin, xmax=xmax, ymin = ymin, ymax=ymax)
     """ % (DictChdTxtOut['AFC2DEL_OUT'])
         txt += """
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", col=TRUE, what='coord', xlab = xlab, ylab = ylab)
+    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", col=TRUE, what='coord', xlab = xlab, ylab = ylab, xmin=xmin, xmax=xmax, ymin = ymin, ymax=ymax)
     """ % (DictChdTxtOut['AFC2DCL_OUT'])
-        txt += """
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=1, fin=(debsup-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=debsup, fin=(debet-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=debet, fin=fin, xlab = xlab, ylab = ylab)
-    PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", col=TRUE, what='crl', xlab = xlab, ylab = ylab)
-    """ % (DictChdTxtOut['AFC2DCoul'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulSup'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulEt'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulCl'])
+#        txt += """
#   PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=1, fin=(debsup-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
#   PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=debsup, fin=(debet-1), xlab = xlab, ylab = ylab)
+  #  PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", what='crl', deb=debet, fin=fin, xlab = xlab, ylab = ylab)
#   PlotAfc2dCoul(afc, as.data.frame(chistabletot), "%s", col=TRUE, what='crl', xlab = xlab, ylab = ylab)
#   """ % (DictChdTxtOut['AFC2DCoul'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulSup'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulEt'], DictChdTxtOut['AFC2DCoulCl'])
        
     txt += """
 #rm(dataact)
index 1caf440..ffbee4c 100644 (file)
@@ -1,18 +1,18 @@
 ############FIXME##################
-PlotDendroComp <- function(chd,filename,reso) {
-   jpeg(filename,res=reso)
-   par(cex=PARCEX)
-   plot(chd,which.plots=2, hang=-1)
-   dev.off()
-}
-
-PlotDendroHori <- function(dendrocutupper,filename,reso) {
-   jpeg(filename,res=reso)
-   par(cex=PARCEX)
-   nP <- list(col=3:2, cex=c(0.5, 0.75), pch= 21:22, bg= c('light blue', 'pink'),lab.cex = 0.75, lab.col = 'tomato')
-   plot(dendrocutupper,nodePar= nP, edgePar = list(col='gray', lwd=2),horiz=TRUE, center=FALSE)
-   dev.off()
-}
+#PlotDendroComp <- function(chd,filename,reso) {
+#   jpeg(filename,res=reso)
+#   par(cex=PARCEX)
+#   plot(chd,which.plots=2, hang=-1)
+#   dev.off()
+#}
+#
+#PlotDendroHori <- function(dendrocutupper,filename,reso) {
+#   jpeg(filename,res=reso)
+#   par(cex=PARCEX)
+#   nP <- list(col=3:2, cex=c(0.5, 0.75), pch= 21:22, bg= c('light blue', 'pink'),lab.cex = 0.75, lab.col = 'tomato')
+#   plot(dendrocutupper,nodePar= nP, edgePar = list(col='gray', lwd=2),horiz=TRUE, center=FALSE)
+#   dev.off()
+#}
 
 PlotDendroCut <- function(chd,filename,reso,clusternb) {   
    h.chd <- as.hclust(chd)
@@ -30,20 +30,20 @@ PlotDendroCut <- function(chd,filename,reso,clusternb) {
    dev.off()
 }
 
-PlotAfc<- function(afc, filename, width=800, height=800, quality=100, reso=200, toplot=c('all','all'), PARCEX=PARCEX) {
-       if (Sys.info()["sysname"]=='Darwin') {
-               width<-width/74.97
-               height<-height/74.97
-               quartz(file=filename,type='jpeg',width=width,height=height)
-       } else {
-               jpeg(filename,width=width,height=height,quality=quality,res=reso)
-       }
-       par(cex=PARCEX)
-       plot(afc,what=toplot,labels=c(1,1),contrib=c('absolute','relative'))
-       dev.off()
-}
-
-PlotAfc2dCoul<- function(afc,chisqrtable,filename, what='coord',col=FALSE, axetoplot=c(1,2), deb=0,fin=0, width=800, height=800, quality=100, reso=200, parcex=PARCEX, xlab = NULL, ylab = NULL) {
+#PlotAfc<- function(afc, filename, width=800, height=800, quality=100, reso=200, toplot=c('all','all'), PARCEX=PARCEX) {
+#      if (Sys.info()["sysname"]=='Darwin') {
+#              width<-width/74.97
+#              height<-height/74.97
+#              quartz(file=filename,type='jpeg',width=width,height=height)
+#      } else {
+#              jpeg(filename,width=width,height=height,quality=quality,res=reso)
+#      }
+#      par(cex=PARCEX)
+#      plot(afc,what=toplot,labels=c(1,1),contrib=c('absolute','relative'))
+#      dev.off()
+#}
+
+PlotAfc2dCoul<- function(afc,chisqrtable,filename, what='coord',col=FALSE, axetoplot=c(1,2), deb=0,fin=0, width=900, height=900, quality=100, reso=200, parcex=PARCEX, xlab = NULL, ylab = NULL, xmin=NULL, xmax=NULL, ymin=NULL, ymax=NUL) {
        if (col) {
                if (what == 'coord') {
                        rowcoord <- as.matrix(afc$colcoord)
@@ -59,7 +59,6 @@ PlotAfc2dCoul<- function(afc,chisqrtable,filename, what='coord',col=FALSE, axeto
        }
        x <- axetoplot[1]
        y <- axetoplot[2]
-       
        if (col)
                rownames(rowcoord) <- afc$colnames
        if (!col){
@@ -73,20 +72,45 @@ PlotAfc2dCoul<- function(afc,chisqrtable,filename, what='coord',col=FALSE, axeto
        }
        clnb <- ncol(chisqrtable)
        
-       if (!col) classes <- as.matrix(apply(chitable,1,which.max))
-       else  classes <- 1:clnb 
-       ntabtot <- cbind(rowcoord, classes)
+       if (!col) {
+        classes <- as.matrix(apply(chitable,1,which.max))
+        cex.par <- norm.vec(apply(chitable,1,max), 0.8,3)
+        row.keep <- select.chi.classe(chitable, 60)
+        rowcoord <- rowcoord[row.keep,]
+        classes <- classes[row.keep]
+        cex.par <- cex.par[row.keep]
+       } else {
+        classes <- 1:clnb
+        cex.par <- rep(1,clnb)
+    }
+       #ntabtot <- cbind(rowcoord, classes)
        #if (!col) ntabtot <- ntabtot[row_keep,]
+    xlab <- paste('facteur ', x, ' -')
+    ylab <- paste('facteur ', y, ' -')
+    xlab <- paste(xlab,round(afc_table$facteur[x,2],2),sep = ' ')
+    xlab <- paste(xlab,' %%',sep = '')
+    ylab <- paste(ylab,round(afc_table$facteur[y,2],2),sep = ' ')
+    ylab <- paste(ylab,' %%',sep = '')
+
        open_file_graph(filename, width = width, height = height)
        par(cex=PARCEX)
-       plot(rowcoord[,x],rowcoord[,y], pch='', xlab = xlab, ylab = ylab)
-       abline(h=0,v=0)
-       for (i in 1:clnb) {
-               ntab <- subset(ntabtot,ntabtot[,ncol(ntabtot)] == i)
-               if (nrow(ntab) != 0)
-                       text(ntab[,x],ntab[,y],rownames(ntab),col=rainbow(clnb)[i])
-       }
-       dev.off()
+
+    table.in <- rowcoord[order(cex.par, decreasing = TRUE),]
+    classes <- classes[order(cex.par, decreasing = TRUE)]
+    cex.par <- cex.par[order(cex.par, decreasing = TRUE)]
+    table.in <- stopoverlap(table.in, cex.par=cex.par)
+    classes <- classes[table.in[,4]]
+    cex.par <- cex.par[table.in[,4]]
+    make_afc_graph(table.in, classes, clnb, xlab, ylab, cex.txt = cex.par, xminmax=c(xmin,xmax), yminmax=c(ymin,ymax))
+    
+       #plot(rowcoord[,x],rowcoord[,y], pch='', xlab = xlab, ylab = ylab)
+       #abline(h=0,v=0)
+       #for (i in 1:clnb) {
+       #       ntab <- subset(ntabtot,ntabtot[,ncol(ntabtot)] == i)
+       #       if (nrow(ntab) != 0)
+       #               text(ntab[,x],ntab[,y],rownames(ntab),col=rainbow(clnb)[i])
+       #}
+       #dev.off()
 }
 
 filename.to.svg <- function(filename) {
@@ -96,11 +120,14 @@ filename.to.svg <- function(filename) {
 
 open_file_graph <- function (filename, width=800, height = 800, quality = 100, svg = FALSE) {
        if (Sys.info()["sysname"] == 'Darwin') {
-               width <- width/74.97
-               height <- height/74.97
-               quartz(file = filename, type = 'jpeg', width = width, height = height)
+        width <- width/74.97
+        height <- height/74.97
+        if (!svg) {
+                   quartz(file = filename, type = 'png', width = width, height = height)
+        } else {
+            svg(filename.to.svg(filename), width=width, height=height)
+        }
        } else {
-        #print('ATTENTION SVG!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!')
         #library(RSvgDevice)
         if (svg) {
             svg(filename.to.svg(filename), width=width/74.97, height=height/74.97)
@@ -110,6 +137,98 @@ open_file_graph <- function (filename, width=800, height = 800, quality = 100, s
        }
 }
 
+#################################################@@
+#from wordcloud
+overlap <- function(x1, y1, sw1, sh1, boxes) {
+    use.r.layout <- FALSE
+       if(!use.r.layout)
+               return(.overlap(x1,y1,sw1,sh1,boxes))
+       s <- 0
+       if (length(boxes) == 0) 
+               return(FALSE)
+       for (i in c(last,1:length(boxes))) {
+               bnds <- boxes[[i]]
+               x2 <- bnds[1]
+               y2 <- bnds[2]
+               sw2 <- bnds[3]
+               sh2 <- bnds[4]
+               if (x1 < x2) 
+                       overlap <- x1 + sw1 > x2-s
+               else 
+                       overlap <- x2 + sw2 > x1-s
+               
+               if (y1 < y2) 
+                       overlap <- overlap && (y1 + sh1 > y2-s)
+               else 
+                       overlap <- overlap && (y2 + sh2 > y1-s)
+               if(overlap){
+                       last <<- i
+                       return(TRUE)
+               }
+       }
+       FALSE
+}
+
+.overlap <- function(x11,y11,sw11,sh11,boxes1){
+    .Call("is_overlap",x11,y11,sw11,sh11,boxes1)
+}
+########################################################
+stopoverlap <- function(x, cex.par = NULL) {
+#from wordcloud
+    library(wordcloud)
+    tails <- "g|j|p|q|y"
+    rot.per <- 0 
+    last <- 1
+    thetaStep <- .1
+    rStep <- .5
+    toplot <- NULL
+
+#    plot.new()
+    plot(x[,1],x[,2], pch='')
+
+    words <- rownames(x)
+    if  (is.null(cex.par))  {
+        size <- rep(0.9, nrow(x))
+    } else {
+        size <- cex.par
+    }
+    #cols <- rainbow(clnb)
+    boxes <- list()
+    for (i in 1:nrow(x)) {
+        rotWord <- runif(1)<rot.per
+        r <-0
+               theta <- runif(1,0,2*pi)
+               x1<- x[i,1] 
+               y1<- x[i,2]
+               wid <- strwidth(words[i],cex=size[i])
+               ht <- strheight(words[i],cex=size[i])
+           ht <- (ht + ht*.2) + .01
+        wid <- (wid + wid*.1) + .01
+               isOverlaped <- TRUE
+               while(isOverlaped){
+                       if(!overlap(x1-.5*wid,y1-.5*ht,wid,ht, boxes)) { #&&
+                toplot <- rbind(toplot, c(x1, y1, size[i], i)) 
+                               #text(x1,y1,words[i],cex=size[i],offset=0,srt=rotWord*90,
+                               #               col=cols[classes[i]])
+                               boxes[[length(boxes)+1]] <- c(x1-.5*wid,y1-.5*ht,wid,ht)
+                               isOverlaped <- FALSE
+                       } else {
+                               if(r>sqrt(.5)){
+                                       print(paste(words[i], "could not be fit on page. It will not be plotted."))
+                                       isOverlaped <- FALSE
+                               }
+                               theta <- theta+thetaStep
+                               r <- r + rStep*thetaStep/(2*pi)
+                x1 <- x[i,1]+r*cos(theta)
+                               y1 <- x[i,2]+r*sin(theta)
+                       }
+               }
+    }
+    row.names(toplot) <- words[toplot[,4]]
+    return(toplot)
+}
+###############################################################################
+
 make_tree_tot <- function (chd) {
        library(ape)
        lf<-chd$list_fille
@@ -185,6 +304,9 @@ select_point_chi <- function(tablechi, chi_limit) {
 
 select.chi.classe <- function(tablechi, nb) {
     rowkeep <- NULL
+    if (nb > nrow(tablechi)) {
+        nb <- nrow(tablechi)
+    }
     for (i in 1:ncol(tablechi)) {
         rowkeep <- append(rowkeep,order(tablechi[,i], decreasing = TRUE)[1:nb])
     }
@@ -305,7 +427,13 @@ create_afc_table <- function(x) {
        res
 }
 
-make_afc_graph <- function(toplot, classes, clnb, xlab, ylab, cex.txt = NULL, leg = FALSE, cmd = FALSE, black = FALSE) {
+make_afc_graph <- function(toplot, classes, clnb, xlab, ylab, cex.txt = NULL, leg = FALSE, cmd = FALSE, black = FALSE, xminmax=NULL, yminmax=NULL) {
+    if (is.null(xminmax)) {
+        xminmax <- c(min(toplot[,1]) + (0.1 * min(toplot[,1])), max(toplot[,1]) + (0.1 * max(toplot[,1])))
+    }
+    if (is.null(yminmax)) {
+        yminmax <- c(min(toplot[,2]) + (0.1 * min(toplot[,2])), max(toplot[,2]) + (0.1 * max(toplot[,2])))
+    }
        rain <- rainbow(clnb)
     compt <- 1
     tochange <- NULL
@@ -328,7 +456,7 @@ make_afc_graph <- function(toplot, classes, clnb, xlab, ylab, cex.txt = NULL, le
     if (black) {
         cl.color <- 'black'
     }
-       plot(toplot[,1],toplot[,2], pch='', xlab = xlab, ylab = ylab)
+       plot(toplot[,1],toplot[,2], pch='', xlab = xlab, ylab = ylab, xlim=xminmax, ylim = yminmax)
        abline(h=0, v=0, lty = 'dashed')
        if (is.null(cex.txt))
                text(toplot[,1],toplot[,2],rownames(toplot),col=cl.color, offset=0)
index cc70625..defdab1 100644 (file)
@@ -153,102 +153,6 @@ if ( qui == 3 ) {
     }
 }
 
-#################################################@@
-#from wordcloud
-overlap <- function(x1, y1, sw1, sh1, boxes) {
-    use.r.layout <- FALSE
-       if(!use.r.layout)
-               return(.overlap(x1,y1,sw1,sh1,boxes))
-       s <- 0
-       if (length(boxes) == 0) 
-               return(FALSE)
-       for (i in c(last,1:length(boxes))) {
-               bnds <- boxes[[i]]
-               x2 <- bnds[1]
-               y2 <- bnds[2]
-               sw2 <- bnds[3]
-               sh2 <- bnds[4]
-               if (x1 < x2) 
-                       overlap <- x1 + sw1 > x2-s
-               else 
-                       overlap <- x2 + sw2 > x1-s
-               
-               if (y1 < y2) 
-                       overlap <- overlap && (y1 + sh1 > y2-s)
-               else 
-                       overlap <- overlap && (y2 + sh2 > y1-s)
-               if(overlap){
-                       last <<- i
-                       return(TRUE)
-               }
-       }
-       FALSE
-}
-
-.overlap <- function(x11,y11,sw11,sh11,boxes1){
-    .Call("is_overlap",x11,y11,sw11,sh11,boxes1)
-}
-
-stopoverlap <- function(x, cex.par = NULL) {
-#from wordcloud
-    library(wordcloud)
-    tails <- "g|j|p|q|y"
-    rot.per <- 0 
-    last <- 1
-    thetaStep <- .1
-    rStep <- .5
-    toplot <- NULL
-
-#    plot.new()
-    plot(x[,1],x[,2], pch='')
-
-    words <- rownames(x)
-    if  (is.null(cex.par))  {
-        size <- rep(0.9, nrow(x))
-    } else {
-        size <- cex.par
-    }
-    #cols <- rainbow(clnb)
-    boxes <- list()
-    for (i in 1:nrow(x)) {
-        rotWord <- runif(1)<rot.per
-        r <-0
-               theta <- runif(1,0,2*pi)
-               x1<- x[i,1] 
-               y1<- x[i,2]
-               wid <- strwidth(words[i],cex=size[i])
-               ht <- strheight(words[i],cex=size[i])
-               if(grepl(tails,words[i]))
-                       ht <- ht + ht*.2
-               if(rotWord){
-                       tmp <- ht
-                       ht <- wid
-                       wid <- tmp      
-               }
-               isOverlaped <- TRUE
-               while(isOverlaped){
-                       if(!overlap(x1-.5*wid,y1-.5*ht,wid,ht, boxes)) { #&&
-                toplot <- rbind(toplot, c(x1, y1, size[i], i)) 
-                               #text(x1,y1,words[i],cex=size[i],offset=0,srt=rotWord*90,
-                               #               col=cols[classes[i]])
-                               boxes[[length(boxes)+1]] <- c(x1-.5*wid,y1-.5*ht,wid,ht)
-                               isOverlaped <- FALSE
-                       } else {
-                               if(r>sqrt(.5)){
-                                       print(paste(words[i], "could not be fit on page. It will not be plotted."))
-                                       isOverlaped <- FALSE
-                               }
-                               theta <- theta+thetaStep
-                               r <- r + rStep*thetaStep/(2*pi)
-                               x1 <- x[i,1]+r*cos(theta)
-                               y1 <- x[i,2]+r*sin(theta)
-                       }
-               }
-    }
-    row.names(toplot) <- words[toplot[,4]]
-    return(toplot)
-}
-###############################################################################
 
 if (typegraph == 0) {
 
@@ -256,6 +160,9 @@ if (typegraph == 0) {
     parcex <- taillecar/10
     par(cex = parcex)
     if (over) {
+    table.in <- table.in[order(cex.par, decreasing = TRUE),]
+    classes <- classes[order(cex.par, decreasing = TRUE)]
+    cex.par <- cex.par[order(cex.par, decreasing = TRUE)]
     table.in <- stopoverlap(table.in, cex.par=cex.par)
     classes <- classes[table.in[,4]]
     cex.par <- cex.par[table.in[,4]]
index 0402cdc..aa562f2 100644 (file)
@@ -199,14 +199,15 @@ class Alceste(AnalyseText) :
         return self.pathout['RTxtProfGraph']
 
     def print_graph_files(self) :
-        afc_graph_list = [[os.path.basename(self.pathout['AFC2DL_OUT']), u'Variables actives - coordonnées - facteurs 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DSL_OUT']), u'variables supplémentaires - coordonnées - facteurs 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DEL_OUT']), u'Variables illustratives - Coordonnées - facteur 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCL_OUT']), u'Classes - Coordonnées - facteur 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoul']), u'Variables actives - Corrélation - facteur 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulSup']), u'Variables supplémentaires - Corrélation - facteur 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulEt']), u'Variables illustratives - Corrélations - facteur 1 / 2'],
-                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulCl']), u'Classes - Corrélations - facteurs 1 / 2'],]
+        mess_afc = u"La position des points n'est peut être pas exacte"
+        afc_graph_list = [[os.path.basename(self.pathout['AFC2DL_OUT']), u'Variables actives - coordonnées - 30 points par classes - facteurs 1 / 2\n%s' % mess_afc],
+                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DSL_OUT']), u'variables supplémentaires - coordonnées - 30 points par classes - facteurs 1 / 2\n%s' % mess_afc],
+                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DEL_OUT']), u'Variables illustratives - Coordonnées - 30 points par classes - facteur 1 / 2\n%s' % mess_afc],
+                      [os.path.basename(self.pathout['AFC2DCL_OUT']), u'Classes - Coordonnées - facteur 1 / 2']]
+                      #[os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoul']), u'Variables actives - Corrélation - facteur 1 / 2'],
+                      #[os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulSup']), u'Variables supplémentaires - Corrélation - facteur 1 / 2'],
+                      #[os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulEt']), u'Variables illustratives - Corrélations - facteur 1 / 2'],
+                      #[os.path.basename(self.pathout['AFC2DCoulCl']), u'Classes - Corrélations - facteurs 1 / 2'],]
         chd_graph_list = [[os.path.basename(self.pathout['dendro1']), u'dendrogramme à partir de chd1']]
         if self.parametres['classif_mode'] == 0 :
             chd_graph_list.append([os.path.basename(self.pathout['dendro2']), u'dendrogramme à partir de chd2'])